Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

CRTC1

CREB regulated transcription coactivator 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
19p13.11
Koordináták
19. kromoszóma: 18 683 680–18 782 333 (GRCh38)
Exonok
14 exon, összesen 98,7 kb
Fehérje
634 aminosav
Más néven ismert
KIAA0616, FLJ14027, TORC1
Korábbi jelölések
MECT1
MANE Select transzkriptum
ENST00000321949.13NM_015321.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) CRTC1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A CRTC1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
19. kromoszóma, a CRTC1 helyét zárójel jelöli. A CRTC1 és környékén 37 gén a 19. kromoszómán, 18 233 007–19 233 006 között.19. kromoszóma19p13.11p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4318,4 Mb18,6 Mb18,8 Mb19 Mb19,2 MbPDE4C: 18 207 961–18 255 419, fordított szálPDE4CPDE4C: 18 207 965–18 248 200, fordított szálCIST1: 18 249 950–18 255 400, fordított szálCIST1IQCN: 18 257 098–18 274 500, fordított szálIQCNJUND: 18 279 694–18 281 622, fordított szálJUNDLSM4: 18 306 231–18 323 112, fordított szálLSM4PGPEP1: 18 340 562–18 369 950, előre szálPGPEP1GDF15: 18 374 731–18 389 176, előre szálGDF15LRRC25: 18 390 351–18 397 622, fordított szálLRRC25SSBP4: 18 418 864–18 434 563, előre szálSSBP4ISYNA1: 18 434 388–18 438 309, fordított szálISYNA1ELL: 18 442 663–18 522 116, fordított szálELLFKBP8: 18 531 751–18 544 264, fordított szálKXD1: 18 557 683–18 569 387, előre szálUBA52: 18 571 722–18 577 550, előre szálUBA52CRLF1: 18 572 220–18 607 741, fordított szálCRLF1REX1BD: 18 588 685–18 592 342, előre szálREX1BDTMEM59L: 18 607 335–18 621 050, előre szálTMEM59LKLHL26: 18 637 018–18 671 721, előre szálKLHL26CRTC1: 18 683 680–18 782 333, előre szálCRTC1COMP: 18 782 773–18 791 312, fordított szálCOMPUPF1: 18 831 905–18 868 232, előre szálUPF1GDF1: 18 868 545–18 896 158, fordított szálGDF1CERS1: 18 868 545–18 896 727, fordított szálCERS1COPE: 18 899 511–18 919 407, fordított szálCOPE: 18 907 013–18 934 397, fordított szálDDX49: 18 919 667–18 929 189, előre szálHOMER3: 18 929 201–18 941 728, fordított szálSUGP2: 18 990 887–19 061 647, fordított szálSUGP2ARMC6: 19 033 575–19 060 311, előre szálARMC6SLC25A42: 19 061 697–19 113 030, előre szálSLC25A42TMEM161A: 19 119 148–19 138 513, fordított szálTMEM161AMEF2B: 19 145 563–19 192 589, fordított szálMEF2BBORCS8-MEF2B: 19 145 569–19 192 158, fordított szálBORCS8-MEF2BBORCS8: 19 163 148–19 192 591, fordított szálBORCS8RFXANK: 19 191 957–19 202 844, előre szálNR2C2AP: 19 201 409–19 203 729, fordított szálNCAN: 19 211 948–19 252 247, előre szálA CRTC1 ábrája: 14 exon a(z) 19. kromoszóma előre szálán1. exon: 18 683 680–18 683 828, 149 bázis2. exon: 18 742 910–18 743 026, 117 bázis3. exon: 18 745 823–18 745 960, 138 bázis4. exon: 18 747 053–18 747 114, 62 bázis5. exon: 18 749 781–18 749 875, 95 bázis6. exon: 18 753 500–18 753 585, 86 bázis7. exon: 18 759 551–18 759 591, 41 bázis8. exon: 18 760 008–18 760 228, 221 bázis9. exon: 18 765 404–18 765 528, 125 bázis10. exon: 18 768 485–18 768 793, 309 bázis11. exon: 18 771 442–18 771 546, 105 bázis12. exon: 18 774 900–18 774 986, 87 bázis13. exon: 18 775 641–18 775 821, 181 bázis14. exon: 18 777 171–18 782 333, 5163 bázis124681012145′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 98,7 kb-jából 6,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1905 bázis kódolja a fehérjét.

CRTC1 szekvenálása

13Könnyű

Mennyire nehéz a CRTC1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A CRTC1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a CRTC1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések6,7%
  • GC-tartalom54%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). CRTC1 gén: CREB regulated transcription coactivator 1. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/crtc1

Vancouver

Dante Labs. CRTC1 gén: CREB regulated transcription coactivator 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/crtc1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet