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Gène

VPS18

VPS18 core subunit of CORVET and HOPS complexes

Résumé

Localisation cytogénétique
15q15.1
Coordonnées
Chromosome 15 : 40 894 450–40 903 975 (GRCh38)
Exons
5 exons sur 9,5 kb
Protéine
973 acides aminés
Aussi appelé
KIAA1475, PEP3
Transcrit MANE Select
ENST00000220509.10NM_020857.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore VPS18. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de VPS18

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 15, avec un crochet à l'emplacement de VPS18. VPS18 et 24 gènes à proximité sur le chromosome 15, de 40 399 213 à 41 399 212.Chromosome 1515q15.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.340,4 Mb40,6 Mb40,8 Mb41 Mb41,2 MbIVD : 40 405 485–40 435 956, brin directIVDBAHD1 : 40 436 611–40 468 242, brin directBAHD1CHST14 : 40 470 984–40 473 158, brin directCHST14CCDC32 : 40 519 519–40 565 054, brin inverseCCDC32RPUSD2 : 40 569 289–40 575 171, brin directRPUSD2KNL1 : 40 594 002–40 664 342, brin directKNL1RAD51 : 40 694 774–40 732 344, brin directRAD51RMDN3 : 40 720 655–40 755 851, brin inverseRMDN3GCHFR : 40 764 043–40 767 872, brin directDNAJC17 : 40 765 161–40 807 498, brin inverseDNAJC17C15orf62 : 40 769 980–40 772 449, brin directC15orf62ZFYVE19 : 40 807 086–40 815 084, brin directZFYVE19PPP1R14D : 40 814 731–40 829 395, brin inversePPP1R14DSPINT1 : 40 843 513–40 860 274, brin directSPINT1RHOV : 40 872 214–40 874 245, brin inverseRHOVVPS18 : 40 894 450–40 903 975, brin directVPS18DLL4 : 40 929 333–40 939 081, brin directDLL4CHAC1 : 40 952 962–40 957 478, brin directCHAC1INO80 : 40 978 880–41 116 568, brin inverseINO80EXD1 : 41 182 725–41 230 757, brin inverseEXD1CHP1 : 41 230 824–41 281 888, brin directCHP1 : 41 284 007–41 380 996, brin directOIP5 : 41 306 412–41 332 680, brin inverseOIP5NUSAP1 : 41 320 794–41 381 367, brin directNUSAP1NDUFAF1 : 41 387 218–41 409 403, brin inverseNDUFAF1Schéma de VPS18 : 5 exons sur le brin direct du chromosome 15Exon 1 : 40 894 450–40 894 859, 410 basesExon 2 : 40 895 938–40 896 079, 142 basesExon 3 : 40 898 907–40 898 998, 92 basesExon 4 : 40 899 144–40 901 014, 1 871 basesExon 5 : 40 902 616–40 903 975, 1 360 bases123455′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,9 kb sur les 9,5 kb du gène ; 2 922 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène VPS18 : VPS18 core subunit of CORVET and HOPS complexes. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/vps18

Vancouver

Dante Labs. Gène VPS18 : VPS18 core subunit of CORVET and HOPS complexes [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/vps18

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