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Gène

SYMPK

symplekin scaffold protein

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.32
Coordonnées
Chromosome 19 : 45 815 410–45 863 147 (GRCh38)
Exons
27 exons sur 47,7 kb
Protéine
1 274 acides aminés
Aussi appelé
SYM, SPK, Pta1
Transcrit MANE Select
ENST00000245934.12NM_004819.3
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SYMPK. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SYMPK

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de SYMPK. SYMPK et 34 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 45 339 279 à 46 339 278.Chromosome 1919q13.32p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4345,4 Mb45,6 Mb45,8 Mb46 Mb46,2 MbKLC3 : 45 333 434–45 351 537, brin directKLC3ERCC2 : 45 349 773–45 370 918, brin inverseERCC2PPP1R13L : 45 379 634–45 406 367, brin inversePPP1R13LPOLR1G : 45 406 644–45 410 737, brin directPOLR1GERCC1 : 45 407 333–45 479 055, brin inverseERCC1FOSB : 45 467 989–45 475 179, brin directFOSBRTN2 : 45 485 292–45 497 055, brin inverseRTN2PPM1N : 45 488 777–45 503 129, brin directPPM1NVASP : 45 506 579–45 527 839, brin directVASPOPA3 : 45 527 767–45 602 212, brin inverseOPA3GPR4 : 45 588 565–45 602 556, brin inverseGPR4EML2 : 45 606 994–45 645 617, brin inverseEML2GIPR : 45 668 207–45 683 722, brin directGIPRSNRPD2 : 45 677 907–45 692 569, brin inverseSNRPD2QPCTL : 45 692 403–45 703 989, brin directQPCTLFBXO46 : 45 710 624–45 730 931, brin inverseFBXO46MEIOSIN : 45 733 439–45 764 541, brin directSIX5 : 45 764 767–45 769 252, brin inverseDMPK : 45 769 709–45 782 794, brin inverseDMPK : 45 779 437–45 785 973, brin inverseDMWD : 45 782 944–45 792 949, brin inverseDMWDRSPH6A : 45 795 713–45 815 308, brin inverseRSPH6ASYMPK : 45 815 410–45 863 147, brin inverseSYMPKFOXA3 : 45 863 989–45 873 798, brin directFOXA3IRF2BP1 : 45 883 608–45 886 141, brin inverseIRF2BP1MYPOP : 45 890 020–45 902 808, brin inverseMYPOPNANOS2 : 45 913 214–45 914 778, brin inverseNANOS2NOVA2 : 45 933 734–45 974 044, brin inverseNOVA2CCDC61 : 45 995 444–46 021 318, brin directCCDC61PGLYRP1 : 46 019 153–46 023 367, brin inversePGLYRP1IGFL4 : 46 039 182–46 077 118, brin inverseIGFL4IGFL2 : 46 079 126–46 161 298, brin directIGFL2IGFL3 : 46 120 067–46 124 698, brin inverseIGFL3IGFL1 : 46 229 732–46 231 243, brin directIGFL1HIF3A : 46 297 026–46 343 433, brin directHIF3ASchéma de SYMPK : 27 exons sur le brin inverse du chromosome 19Exon 27 : 45 815 410–45 815 697, 288 basesExon 26 : 45 815 851–45 816 183, 333 basesExon 25 : 45 816 482–45 816 577, 96 basesExon 24 : 45 816 798–45 816 974, 177 basesExon 23 : 45 817 959–45 818 146, 188 basesExon 22 : 45 821 384–45 821 485, 102 basesExon 21 : 45 822 756–45 822 846, 91 basesExon 20 : 45 823 372–45 823 472, 101 basesExon 19 : 45 823 767–45 823 875, 109 basesExon 18 : 45 825 171–45 825 331, 161 basesExon 17 : 45 826 226–45 826 373, 148 basesExon 16 : 45 827 510–45 827 623, 114 basesExon 15 : 45 827 837–45 827 918, 82 basesExon 14 : 45 828 970–45 829 205, 236 basesExon 13 : 45 830 054–45 830 204, 151 basesExon 12 : 45 831 384–45 831 588, 205 basesExon 11 : 45 835 078–45 835 228, 151 basesExon 10 : 45 838 461–45 838 615, 155 basesExon 9 : 45 842 250–45 842 489, 240 basesExon 8 : 45 844 030–45 844 200, 171 basesExon 7 : 45 847 752–45 848 001, 250 basesExon 6 : 45 848 750–45 848 876, 127 basesExon 5 : 45 852 312–45 852 385, 74 basesExon 4 : 45 852 482–45 852 535, 54 basesExon 3 : 45 854 175–45 854 240, 66 basesExon 2 : 45 854 391–45 854 507, 117 basesExon 1 : 45 863 058–45 863 147, 90 bases27201015′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,1 kb sur les 47,7 kb du gène ; 3 825 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

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Dante Labs. (s.d.). Gène SYMPK : symplekin scaffold protein. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sympk

Vancouver

Dante Labs. Gène SYMPK : symplekin scaffold protein [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sympk

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