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Gène

SMG6

SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor

Résumé

Localisation cytogénétique
17p13.3
Coordonnées
Chromosome 17 : 2 059 843–2 303 785 (GRCh38)
Exons
19 exons sur 243,9 kb
Protéine
1 419 acides aminés
Aussi appelé
KIAA0732, SMG-6, EST1A
Symboles précédents
C17orf31
Transcrit MANE Select
ENST00000263073.11NM_017575.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SMG6. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SMG6

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de SMG6. SMG6 et 17 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 1 681 814 à 2 681 813.Chromosome 1717p13.3p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.31,8 Mb2 Mb2,2 Mb2,4 Mb2,6 MbPRPF8 : 1 650 624–1 684 909, brin inversePRPF8TLCD2 : 1 688 598–1 710 639, brin inverseTLCD2WDR81 : 1 716 523–1 738 599, brin directWDR81SERPINF2 : 1 742 069–1 755 271, brin directSERPINF2SERPINF1 : 1 761 958–1 777 627, brin directSERPINF1SMYD4 : 1 779 485–1 830 634, brin inverseSMYD4RPA1 : 1 829 702–1 900 082, brin directRPA1RTN4RL1 : 1 934 677–2 025 355, brin inverseRTN4RL1DPH1 : 2 030 136–2 043 898, brin directDPH1OVCA2 : 2 042 022–2 043 898, brin directOVCA2HIC1 : 2 054 154–2 063 241, brin directHIC1SMG6 : 2 059 843–2 303 785, brin inverseSMG6SRR : 2 303 383–2 326 656, brin directSRRTSR1 : 2 322 376–2 337 965, brin inverseTSR1SGSM2 : 2 337 488–2 381 058, brin directSGSM2MNT : 2 384 073–2 401 142, brin inverseMNTMETTL16 : 2 405 562–2 511 904, brin inverseMETTL16PAFAH1B1 : 2 593 183–2 685 627, brin directPAFAH1B1Schéma de SMG6 : 19 exons sur le brin inverse du chromosome 17Exon 19 : 2 059 843–2 061 622, 1 780 basesExon 18 : 2 065 073–2 065 154, 82 basesExon 17 : 2 065 468–2 065 679, 212 basesExon 16 : 2 068 778–2 068 931, 154 basesExon 15 : 2 081 810–2 081 956, 147 basesExon 14 : 2 085 725–2 085 901, 177 basesExon 13 : 2 172 658–2 172 859, 202 basesExon 12 : 2 186 663–2 186 831, 169 basesExon 11 : 2 188 399–2 188 515, 117 basesExon 10 : 2 236 492–2 236 637, 146 basesExon 9 : 2 244 658–2 244 719, 62 basesExon 8 : 2 282 647–2 282 859, 213 basesExon 7 : 2 283 625–2 283 735, 111 basesExon 6 : 2 292 552–2 292 630, 79 basesExon 5 : 2 292 871–2 292 977, 107 basesExon 4 : 2 297 243–2 297 353, 111 basesExon 3 : 2 297 863–2 298 055, 193 basesExon 2 : 2 298 906–2 300 664, 1 759 basesExon 1 : 2 303 633–2 303 785, 153 bases191510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 6 kb sur les 243,9 kb du gène ; 4 260 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SMG6 : SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/smg6

Vancouver

Dante Labs. Gène SMG6 : SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/smg6

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