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Gen

SMG6

SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
17p13.3
Koordinaten
Chromosom 17: 2.059.843–2.303.785 (GRCh38)
Exons
19 Exons über 243,9 kb
Protein
1.419 Aminosäuren
Auch bekannt als
KIAA0732, SMG-6, EST1A
Frühere Symbole
C17orf31
MANE-Select-Transkript
ENST00000263073.11NM_017575.5
Locus-Typ
gene with protein product

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet SMG6 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von SMG6

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 17, mit einer Klammer, an der SMG6 liegt. SMG6 und 17 Gene in der Nähe auf Chromosom 17, von 1.681.814 bis 2.681.813.Chromosom 1717p13.3p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.31,8 Mb2 Mb2,2 Mb2,4 Mb2,6 MbPRPF8: 1.650.624–1.684.909, Minus-StrangPRPF8TLCD2: 1.688.598–1.710.639, Minus-StrangTLCD2WDR81: 1.716.523–1.738.599, Plus-StrangWDR81SERPINF2: 1.742.069–1.755.271, Plus-StrangSERPINF2SERPINF1: 1.761.958–1.777.627, Plus-StrangSERPINF1SMYD4: 1.779.485–1.830.634, Minus-StrangSMYD4RPA1: 1.829.702–1.900.082, Plus-StrangRPA1RTN4RL1: 1.934.677–2.025.355, Minus-StrangRTN4RL1DPH1: 2.030.136–2.043.898, Plus-StrangDPH1OVCA2: 2.042.022–2.043.898, Plus-StrangOVCA2HIC1: 2.054.154–2.063.241, Plus-StrangHIC1SMG6: 2.059.843–2.303.785, Minus-StrangSMG6SRR: 2.303.383–2.326.656, Plus-StrangSRRTSR1: 2.322.376–2.337.965, Minus-StrangTSR1SGSM2: 2.337.488–2.381.058, Plus-StrangSGSM2MNT: 2.384.073–2.401.142, Minus-StrangMNTMETTL16: 2.405.562–2.511.904, Minus-StrangMETTL16PAFAH1B1: 2.593.183–2.685.627, Plus-StrangPAFAH1B1Diagramm von SMG6: 19 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 17Exon 19: 2.059.843–2.061.622, 1.780 BasenExon 18: 2.065.073–2.065.154, 82 BasenExon 17: 2.065.468–2.065.679, 212 BasenExon 16: 2.068.778–2.068.931, 154 BasenExon 15: 2.081.810–2.081.956, 147 BasenExon 14: 2.085.725–2.085.901, 177 BasenExon 13: 2.172.658–2.172.859, 202 BasenExon 12: 2.186.663–2.186.831, 169 BasenExon 11: 2.188.399–2.188.515, 117 BasenExon 10: 2.236.492–2.236.637, 146 BasenExon 9: 2.244.658–2.244.719, 62 BasenExon 8: 2.282.647–2.282.859, 213 BasenExon 7: 2.283.625–2.283.735, 111 BasenExon 6: 2.292.552–2.292.630, 79 BasenExon 5: 2.292.871–2.292.977, 107 BasenExon 4: 2.297.243–2.297.353, 111 BasenExon 3: 2.297.863–2.298.055, 193 BasenExon 2: 2.298.906–2.300.664, 1.759 BasenExon 1: 2.303.633–2.303.785, 153 Basen191510515′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 6 kb der 243,9 kb des Gens aus; 4.260 dieser Basen kodieren für das Protein.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.

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APA

Dante Labs. (o. J.). SMG6-Gen: SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor. Abgerufen am 16. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/smg6

Vancouver

Dante Labs. SMG6-Gen: SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor [Internet]. [zitiert am 16. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/smg6

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