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Gene

SMG6

SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor

Sintesi

Localizzazione citogenetica
17p13.3
Coordinate
Cromosoma 17: 2.059.843–2.303.785 (GRCh38)
Esoni
19 esoni su 243,9 kb
Proteina
1419 amminoacidi
Noto anche come
KIAA0732, SMG-6, EST1A
Simboli precedenti
C17orf31
Trascritto MANE Select
ENST00000263073.11NM_017575.5
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SMG6. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SMG6

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 17, con una parentesi dove si trova SMG6. SMG6 e 17 geni nelle vicinanze sul cromosoma 17, da 1.681.814 a 2.681.813.Cromosoma 1717p13.3p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.31,8 Mb2 Mb2,2 Mb2,4 Mb2,6 MbPRPF8: 1.650.624–1.684.909, filamento inversoPRPF8TLCD2: 1.688.598–1.710.639, filamento inversoTLCD2WDR81: 1.716.523–1.738.599, filamento direttoWDR81SERPINF2: 1.742.069–1.755.271, filamento direttoSERPINF2SERPINF1: 1.761.958–1.777.627, filamento direttoSERPINF1SMYD4: 1.779.485–1.830.634, filamento inversoSMYD4RPA1: 1.829.702–1.900.082, filamento direttoRPA1RTN4RL1: 1.934.677–2.025.355, filamento inversoRTN4RL1DPH1: 2.030.136–2.043.898, filamento direttoDPH1OVCA2: 2.042.022–2.043.898, filamento direttoOVCA2HIC1: 2.054.154–2.063.241, filamento direttoHIC1SMG6: 2.059.843–2.303.785, filamento inversoSMG6SRR: 2.303.383–2.326.656, filamento direttoSRRTSR1: 2.322.376–2.337.965, filamento inversoTSR1SGSM2: 2.337.488–2.381.058, filamento direttoSGSM2MNT: 2.384.073–2.401.142, filamento inversoMNTMETTL16: 2.405.562–2.511.904, filamento inversoMETTL16PAFAH1B1: 2.593.183–2.685.627, filamento direttoPAFAH1B1Diagramma di SMG6: 19 esoni sul filamento inverso del cromosoma 17Esone 19: 2.059.843–2.061.622, 1780 basiEsone 18: 2.065.073–2.065.154, 82 basiEsone 17: 2.065.468–2.065.679, 212 basiEsone 16: 2.068.778–2.068.931, 154 basiEsone 15: 2.081.810–2.081.956, 147 basiEsone 14: 2.085.725–2.085.901, 177 basiEsone 13: 2.172.658–2.172.859, 202 basiEsone 12: 2.186.663–2.186.831, 169 basiEsone 11: 2.188.399–2.188.515, 117 basiEsone 10: 2.236.492–2.236.637, 146 basiEsone 9: 2.244.658–2.244.719, 62 basiEsone 8: 2.282.647–2.282.859, 213 basiEsone 7: 2.283.625–2.283.735, 111 basiEsone 6: 2.292.552–2.292.630, 79 basiEsone 5: 2.292.871–2.292.977, 107 basiEsone 4: 2.297.243–2.297.353, 111 basiEsone 3: 2.297.863–2.298.055, 193 basiEsone 2: 2.298.906–2.300.664, 1759 basiEsone 1: 2.303.633–2.303.785, 153 basi191510515′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 6 kb dei 243,9 kb del gene; 4260 di queste basi codificano la proteina.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SMG6: SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/smg6

Vancouver

Dante Labs. Gene SMG6: SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/smg6

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