Aller au contenu
Utilisez vos fonds HSA ou FSA
Séquencez votre génome (s’ouvre dans un nouvel onglet)

Gène

PTGIR

prostaglandin I2 receptor

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.32
Coordonnées
Chromosome 19 : 46 620 468–46 625 089 (GRCh38)
Exons
3 exons sur 4,6 kb
Protéine
386 acides aminés
Aussi appelé
IP
Transcrit MANE Select
ENST00000291294.7NM_000960.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PTGIR. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PTGIR

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de PTGIR. PTGIR et 22 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 46 122 779 à 47 122 778.Chromosome 1919q13.32p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4346,2 Mb46,4 Mb46,6 Mb46,8 Mb47 MbIGFL2 : 46 079 126–46 161 298, brin directIGFL2IGFL3 : 46 120 067–46 124 698, brin inverseIGFL3IGFL1 : 46 229 732–46 231 243, brin directIGFL1HIF3A : 46 297 026–46 343 433, brin directHIF3APPP5C : 46 346 994–46 393 000, brin directPPP5CCCDC8 : 46 410 329–46 413 564, brin inverseCCDC8PNMA8C : 46 424 697–46 428 936, brin inversePNMA8CPNMA8A : 46 466 491–46 471 572, brin inversePNMA8APNMA8B : 46 486 906–46 495 879, brin inversePNMA8BCALM3 : 46 601 074–46 610 795, brin directCALM3PTGIR : 46 620 468–46 625 089, brin inversePTGIRGNG8 : 46 633 947–46 639 623, brin inverseGNG8DACT3 : 46 646 872–46 661 199, brin inverseDACT3PRKD2 : 46 673 661–46 717 144, brin inversePRKD2STRN4 : 46 719 507–46 746 994, brin inverseSTRN4FKRP : 46 746 046–46 776 988, brin directFKRPSLC1A5 : 46 758 394–46 788 617, brin inverseSLC1A5AP2S1 : 46 838 136–46 850 962, brin inverseAP2S1ARHGAP35 : 46 860 433–47 005 077, brin directARHGAP35NPAS1 : 47 019 474–47 047 242, brin directNPAS1TMEM160 : 47 045 909–47 048 650, brin inverseTMEM160ZC3H4 : 47 064 187–47 113 776, brin inverseZC3H4SAE1 : 47 113 274–47 210 636, brin directSAE1Schéma de PTGIR : 3 exons sur le brin inverse du chromosome 19Exon 3 : 46 620 468–46 621 672, 1 205 basesExon 2 : 46 623 458–46 624 237, 780 basesExon 1 : 46 624 997–46 625 089, 93 bases3215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,1 kb sur les 4,6 kb du gène ; 1 161 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de PTGIR

6Facile

Difficulté de séquençage de PTGIR avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de PTGIR se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Ce qui s'y ajoute : la part des exons de PTGIR dans chaque type de zone difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions0,8 %
  • Teneur en GC56 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PTGIR : prostaglandin I2 receptor. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ptgir

Vancouver

Dante Labs. Gène PTGIR : prostaglandin I2 receptor [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ptgir

Un seul test. Des réponses pour toute la vie.

À partir de 449 $Livraison gratuite · Résultats sous 6 à 8 semaines

Obtenir mon Genome Test