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Gène

NPAS1

neuronal PAS domain protein 1

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.32
Coordonnées
Chromosome 19 : 47 019 837–47 045 775 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 25,9 kb
Protéine
590 acides aminés
Aussi appelé
MOP5, PASD5, bHLHe11
Transcrit MANE Select
ENST00000602212.6NM_002517.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore NPAS1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de NPAS1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de NPAS1. NPAS1 et 24 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 46 532 806 à 47 532 805.Chromosome 1919q13.32p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4346,6 Mb46,8 Mb47 Mb47,2 Mb47,4 MbCALM3 : 46 601 074–46 610 795, brin directCALM3PTGIR : 46 618 550–46 625 534, brin inversePTGIRGNG8 : 46 633 947–46 639 623, brin inverseGNG8DACT3 : 46 646 872–46 661 199, brin inverseDACT3PRKD2 : 46 673 661–46 717 144, brin inversePRKD2STRN4 : 46 719 507–46 746 994, brin inverseSTRN4FKRP : 46 746 046–46 776 988, brin directFKRPSLC1A5 : 46 758 394–46 788 617, brin inverseSLC1A5AP2S1 : 46 838 136–46 850 962, brin inverseAP2S1ARHGAP35 : 46 860 433–47 005 077, brin directARHGAP35NPAS1 : 47 019 837–47 045 775, brin directNPAS1TMEM160 : 47 045 909–47 048 650, brin inverseTMEM160ZC3H4 : 47 064 187–47 113 776, brin inverseZC3H4SAE1 : 47 113 274–47 210 636, brin directSAE1BBC3 : 47 220 822–47 233 019, brin inverseBBC3CCDC9 : 47 255 980–47 274 055, brin directCCDC9INAFM1 : 47 274 373–47 277 755, brin directINAFM1C5AR1 : 47 290 023–47 322 075, brin directC5AR1C5AR2 : 47 332 148–47 347 329, brin directC5AR2DHX34 : 47 349 280–47 383 255, brin directDHX34MEIS3 : 47 403 117–47 419 530, brin inverseMEIS3SLC8A2 : 47 428 017–47 472 184, brin inverseSLC8A2KPTN : 47 475 141–47 484 265, brin inverseKPTNNAPA : 47 484 530–47 515 122, brin inverseNAPAZNF541 : 47 520 638–47 573 148, brin inverseZNF541Schéma de NPAS1 : 12 exons sur le brin direct du chromosome 19Exon 1 : 47 019 837–47 019 997, 161 basesExon 2 : 47 021 006–47 021 169, 164 basesExon 3 : 47 021 612–47 021 847, 236 basesExon 4 : 47 032 278–47 032 351, 74 basesExon 5 : 47 032 643–47 032 732, 90 basesExon 6 : 47 035 964–47 036 129, 166 basesExon 7 : 47 039 036–47 039 151, 116 basesExon 8 : 47 039 407–47 039 564, 158 basesExon 9 : 47 040 444–47 040 550, 107 basesExon 10 : 47 040 978–47 041 125, 148 basesExon 11 : 47 042 810–47 042 904, 95 basesExon 12 : 47 045 191–47 045 775, 585 bases1246810125′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,1 kb sur les 25,9 kb du gène ; 1 773 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

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Dante Labs. (s.d.). Gène NPAS1 : neuronal PAS domain protein 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/npas1

Vancouver

Dante Labs. Gène NPAS1 : neuronal PAS domain protein 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/npas1

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