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Gène

LIME1

Lck interacting transmembrane adaptor 1

Résumé

Localisation cytogénétique
20q13.33
Coordonnées
Chromosome 20 : 63 736 664–63 739 103 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 2,4 kb
Protéine
295 acides aminés
Aussi appelé
FLJ20406, dJ583P15.4, LIME
Transcrit MANE Select
ENST00000309546.8NM_017806.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore LIME1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de LIME1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 20, avec un crochet à l'emplacement de LIME1. LIME1 et 38 gènes à proximité sur le chromosome 20, de 63 237 884 à 64 237 883.Chromosome 2020q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3363,4 Mb63,6 Mb63,8 Mb64 Mb64,2 MbBIRC7 : 63 235 435–63 240 497, brin directBIRC7NKAIN4 : 63 240 784–63 272 694, brin inverseNKAIN4ARFGAP1 : 63 272 785–63 289 791, brin directARFGAP1COL20A1 : 63 293 186–63 334 851, brin directCOL20A1CHRNA4 : 63 343 223–63 378 401, brin inverseCHRNA4KCNQ2 : 63 400 208–63 472 689, brin inverseKCNQ2EEF1A2 : 63 477 488–63 500 533, brin inverseEEF1A2PPDPF : 63 520 255–63 532 108, brin directPTK6 : 63 526 306–63 537 770, brin inversePTK6SRMS : 63 538 489–63 547 752, brin inverseSRMSFNDC11 : 63 547 891–63 558 138, brin directFNDC11HELZ2 : 63 558 086–63 574 239, brin inverseHELZ2GMEB2 : 63 587 601–63 628 426, brin inverseGMEB2STMN3 : 63 639 705–63 657 682, brin inverseSTMN3RTEL1 : 63 657 810–63 696 253, brin directRTEL1RTEL1-TNFRSF6B : 63 659 300–63 698 684, brin directTNFRSF6B : 63 696 368–63 698 689, brin directARFRP1 : 63 698 622–63 708 662, brin inverseZGPAT : 63 707 353–63 736 150, brin direct : 63 708 864–63 739 103, brin directLIME1 : 63 736 664–63 739 103, brin directLIME1 : 63 738 270–63 740 398, brin directSLC2A4RG : 63 739 758–63 744 603, brin directSLC2A4RGZBTB46 : 63 743 668–63 832 455, brin inverseABHD16B : 63 861 498–63 862 988, brin directABHD16BTPD52L2 : 63 865 199–63 892 266, brin directTPD52L2DNAJC5 : 63 894 641–63 939 899, brin directDNAJC5UCKL1 : 63 939 811–63 956 500, brin inverseUCKL1ZNF512B : 63 956 704–63 969 967, brin inverseZNF512BSAMD10 : 63 973 610–63 980 008, brin inverseSAMD10PRPF6 : 63 979 671–64 033 984, brin directPRPF6C20orf204 : 64 034 344–64 039 962, brin directC20orf204SOX18 : 64 047 582–64 050 629, brin inverseSOX18TCEA2 : 64 049 836–64 072 352, brin directTCEA2RGS19 : 64 073 181–64 079 988, brin inverseRGS19OPRL1 : 64 079 967–64 100 649, brin directLKAAEAR1 : 64 083 376–64 084 967, brin inverseMYT1 : 64 102 222–64 242 253, brin directMYT1NPBWR2 : 64 103 802–64 107 565, brin inverseSchéma de LIME1 : 6 exons sur le brin direct du chromosome 20Exon 1 : 63 736 664–63 736 712, 49 basesExon 2 : 63 737 533–63 737 647, 115 basesExon 3 : 63 737 821–63 737 902, 82 basesExon 4 : 63 737 973–63 738 060, 88 basesExon 5 : 63 738 183–63 738 499, 317 basesExon 6 : 63 738 598–63 739 103, 506 bases1234565′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,2 kb sur les 2,4 kb du gène ; 888 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène LIME1 : Lck interacting transmembrane adaptor 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/lime1

Vancouver

Dante Labs. Gène LIME1 : Lck interacting transmembrane adaptor 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/lime1

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