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Gène

HOMER3

homer scaffold protein 3

Résumé

Localisation cytogénétique
19p13.11
Coordonnées
Chromosome 19 : 18 929 203–18 941 217 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 12 kb
Protéine
361 acides aminés
Aussi appelé
HOMER-3
Transcrit MANE Select
ENST00000392351.8NM_004838.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore HOMER3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de HOMER3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de HOMER3. HOMER3 et 32 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 18 435 210 à 19 435 209.Chromosome 1919p13.11p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4318,6 Mb18,8 Mb19 Mb19,2 Mb19,4 MbISYNA1 : 18 434 388–18 438 309, brin inverseISYNA1ELL : 18 442 663–18 522 116, brin inverseELLFKBP8 : 18 531 751–18 544 264, brin inverseKXD1 : 18 557 683–18 569 387, brin directUBA52 : 18 571 722–18 577 550, brin directUBA52CRLF1 : 18 572 220–18 607 741, brin inverseCRLF1REX1BD : 18 588 685–18 592 342, brin directREX1BDTMEM59L : 18 607 335–18 621 050, brin directTMEM59LKLHL26 : 18 637 018–18 671 721, brin directKLHL26CRTC1 : 18 683 575–18 782 333, brin directCRTC1COMP : 18 782 773–18 791 312, brin inverseCOMPUPF1 : 18 831 905–18 868 232, brin directUPF1CERS1 : 18 868 545–18 896 727, brin inverseGDF1 : 18 868 545–18 896 158, brin inverseCOPE : 18 899 511–18 919 407, brin inverseCOPE : 18 907 013–18 934 397, brin inverseDDX49 : 18 919 667–18 929 189, brin directDDX49HOMER3 : 18 929 203–18 941 217, brin inverseHOMER3SUGP2 : 18 990 887–19 061 647, brin inverseSUGP2ARMC6 : 19 033 575–19 060 311, brin directARMC6SLC25A42 : 19 061 697–19 113 030, brin directSLC25A42TMEM161A : 19 119 148–19 138 513, brin inverseTMEM161AMEF2B : 19 145 563–19 192 589, brin inverseMEF2BBORCS8-MEF2B : 19 145 569–19 192 158, brin inverseBORCS8-MEF2BBORCS8 : 19 163 148–19 192 591, brin inverseBORCS8RFXANK : 19 191 957–19 202 844, brin directNR2C2AP : 19 201 409–19 203 729, brin inverseNCAN : 19 211 948–19 252 247, brin directHAPLN4 : 19 254 731–19 262 827, brin inverseHAPLN4TM6SF2 : 19 263 385–19 273 406, brin inverseTM6SF2SUGP1 : 19 276 018–19 320 511, brin inverseSUGP1MAU2 : 19 320 811–19 358 754, brin directMAU2GATAD2A : 19 385 638–19 508 932, brin directGATAD2ASchéma de HOMER3 : 10 exons sur le brin inverse du chromosome 19Exon 10 : 18 929 203–18 929 634, 432 basesExon 9 : 18 931 325–18 931 411, 87 basesExon 8 : 18 931 509–18 931 625, 117 basesExon 7 : 18 931 976–18 932 132, 157 basesExon 6 : 18 932 924–18 933 045, 122 basesExon 5 : 18 934 303–18 934 410, 108 basesExon 4 : 18 938 353–18 938 484, 132 basesExon 3 : 18 938 728–18 938 884, 157 basesExon 2 : 18 938 969–18 939 049, 81 basesExon 1 : 18 941 051–18 941 217, 167 bases109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,6 kb sur les 12 kb du gène ; 1 086 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène HOMER3 : homer scaffold protein 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/homer3

Vancouver

Dante Labs. Gène HOMER3 : homer scaffold protein 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/homer3

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