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Gène

GOT1L1

glutamic-oxaloacetic transaminase 1 like 1

Résumé

Localisation cytogénétique
8p11.23
Coordonnées
Chromosome 8 : 37 934 281–37 940 124 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 5,8 kb
Protéine
421 acides aminés
Aussi appelé
MGC33309
Transcrit MANE Select
ENST00000307599.5NM_152413.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore GOT1L1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de GOT1L1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 8, avec un crochet à l'emplacement de GOT1L1. GOT1L1 et 18 gènes à proximité sur le chromosome 8, de 37 437 203 à 38 437 202.Chromosome 88p11.23p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.337,6 Mb37,8 Mb38 Mb38,2 Mb38,4 MbZNF703 : 37 695 744–37 700 019, brin directZNF703ERLIN2 : 37 736 587–37 758 422, brin directERLIN2PLPBP : 37 762 580–37 782 218, brin directPLPBPADGRA2 : 37 784 191–37 844 896, brin directADGRA2BRF2 : 37 843 268–37 849 911, brin inverseBRF2RAB11FIP1 : 37 858 618–37 899 513, brin inverseRAB11FIP1GOT1L1 : 37 934 281–37 940 124, brin inverseGOT1L1 : 37 934 340–37 965 953, brin inverseADRB3 : 37 962 990–37 966 614, brin inverseADRB3EIF4EBP1 : 38 030 494–38 060 380, brin directEIF4EBP1ASH2L : 38 105 493–38 144 124, brin directASH2LSTAR : 38 138 571–38 151 102, brin inverseSTARLSM1 : 38 161 436–38 176 730, brin inverseLSM1BAG4 : 38 176 533–38 215 427, brin directBAG4DDHD2 : 38 225 218–38 283 357, brin directDDHD2PLPP5 : 38 263 095–38 269 519, brin inversePLPP5NSD3 : 38 269 704–38 383 021, brin inverseNSD3LETM2 : 38 386 204–38 409 527, brin directLETM2FGFR1 : 38 400 215–38 468 834, brin inverseFGFR1Schéma de GOT1L1 : 9 exons sur le brin inverse du chromosome 8Exon 9 : 37 934 281–37 934 486, 206 basesExon 8 : 37 935 073–37 935 215, 143 basesExon 7 : 37 935 704–37 935 869, 166 basesExon 6 : 37 936 720–37 936 870, 151 basesExon 5 : 37 936 965–37 937 057, 93 basesExon 4 : 37 937 277–37 937 386, 110 basesExon 3 : 37 937 638–37 937 749, 112 basesExon 2 : 37 938 700–37 938 881, 182 basesExon 1 : 37 939 915–37 940 124, 210 bases9876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,4 kb sur les 5,8 kb du gène ; 1 266 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de GOT1L1

0Facile

Difficulté de séquençage de GOT1L1 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de GOT1L1 se situent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Facteur aggravant : la part des exons de GOT1L1 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions2,6 %
  • Teneur en GC0 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène GOT1L1 : glutamic-oxaloacetic transaminase 1 like 1. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/got1l1

Vancouver

Dante Labs. Gène GOT1L1 : glutamic-oxaloacetic transaminase 1 like 1 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/got1l1

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