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Gène

RAB11FIP1

RAB11 family interacting protein 1

Résumé

Localisation cytogénétique
8p11.23
Coordonnées
Chromosome 8 : 37 858 618–37 899 497 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 40,9 kb
Protéine
1 283 acides aminés
Aussi appelé
RCP, FLJ22622, FLJ22524, Rab11-FIP1
Transcrit MANE Select
ENST00000330843.9NM_001002814.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore RAB11FIP1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de RAB11FIP1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 8, avec un crochet à l'emplacement de RAB11FIP1. RAB11FIP1 et 16 gènes à proximité sur le chromosome 8, de 37 379 058 à 38 379 057.Chromosome 88p11.23p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.337,4 Mb37,6 Mb37,8 Mb38 Mb38,2 MbZNF703 : 37 695 744–37 700 019, brin directZNF703ERLIN2 : 37 736 587–37 758 422, brin directERLIN2PLPBP : 37 762 580–37 782 218, brin directPLPBPADGRA2 : 37 784 191–37 844 896, brin directADGRA2BRF2 : 37 843 268–37 849 911, brin inverseBRF2RAB11FIP1 : 37 858 618–37 899 497, brin inverseRAB11FIP1GOT1L1 : 37 934 281–37 940 162, brin inverseGOT1L1 : 37 934 340–37 965 953, brin inverseADRB3 : 37 962 990–37 966 614, brin inverseADRB3EIF4EBP1 : 38 030 494–38 060 380, brin directEIF4EBP1ASH2L : 38 105 493–38 144 124, brin directASH2LSTAR : 38 138 571–38 151 102, brin inverseSTARLSM1 : 38 161 436–38 176 730, brin inverseLSM1BAG4 : 38 176 533–38 215 427, brin directBAG4DDHD2 : 38 225 218–38 283 357, brin directDDHD2PLPP5 : 38 263 095–38 269 519, brin inversePLPP5NSD3 : 38 269 704–38 383 021, brin inverseNSD3Schéma de RAB11FIP1 : 6 exons sur le brin inverse du chromosome 8Exon 6 : 37 858 618–37 863 113, 4 496 basesExon 5 : 37 870 420–37 870 528, 109 basesExon 4 : 37 871 278–37 873 179, 1 902 basesExon 3 : 37 874 515–37 875 322, 808 basesExon 2 : 37 877 109–37 877 551, 443 basesExon 1 : 37 899 071–37 899 497, 427 bases6543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 8,2 kb sur les 40,9 kb du gène ; 3 852 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de RAB11FIP1

1Faible

Difficulté de séquençage de RAB11FIP1 avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions5,2 %
  • Teneur en GC5,2 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène RAB11FIP1 : RAB11 family interacting protein 1. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rab11fip1

Vancouver

Dante Labs. Gène RAB11FIP1 : RAB11 family interacting protein 1 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rab11fip1

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