Variant
CDH1 c.467G>A
NM_004360.5(CDH1):c.467G>A (p.Trp156Ter)
- p.Trp156Ter
- p.W156*
- rs1555515215
- Classification ClinVar
- Pathogène
- Statut de l'examen
- 3 étoiles sur 4examiné par un groupe d'experts
- Dernière évaluation
- 4 août 2023
- Groupe d'experts
- Clingen Gastric Cancer Variant Curation Expert Panel
Données à jour de la version 2026-10-12 de ClinVar · version 2026.10.16-c6eea6bf des données de Dante LabsFaits modifiés pour la dernière fois le 16 octobre 2026
Génome de référenceGRCh38hg38
Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.
Résumé
c.467G>A est un variant non-sens dans CDH1 : il crée un signal d'arrêt précoce, si bien que la protéine codée par le gène devrait être tronquée. ClinVar le classe comme pathogène pour CDH1-related diffuse gastric and lobular breast cancer syndrome (examiné par un groupe d'experts).
Classifications ClinVar
| Affection | Classification | Statut de l'examen | Soumissions | Dernière évaluation |
|---|---|---|---|---|
| CDH1-related diffuse gastric and lobular breast cancer syndromeClinVar VCV000463781 (s'ouvre dans un nouvel onglet) | Pathogène | 3 étoiles sur 4examiné par un groupe d'experts | 1 soumission | 4 août 2023 |
Classifications telles qu'elles sont enregistrées dans ClinVar, version 2026-10-12. ClinVar les met à jour à mesure que les données probantes sont examinées.
Où il se situe dans CDH1
c.467G>A se trouve dans l'exon 4 parmi les 16 exons du transcrit MANE Select de CDH1, NM_004360.5.
Détails moléculaires
| Gène | CDH1 |
|---|---|
| Transcrit | NM_004360.5MANE Select |
| Changement d'ADN codant (HGVS c.) | c.467G>A |
| Changement de protéine (HGVS p.) | p.Trp156Terp.W156* |
| Conséquence prédite | Non-sens (codon stop gagné)stop_gained (s'ouvre dans un nouvel onglet) |
| Impact prédit | Élevé |
| Position (GRCh38) | chr16:68808503 G>A |
| Position (GRCh37) | chr16:68842406 G>A |
| ID dbSNP | rs1555515215 (s'ouvre dans un nouvel onglet) |
| ID de variation ClinVar | VCV000463781 (s'ouvre dans un nouvel onglet) |
| Identifiant d'allèle ClinVar | 466817 |
| Identifiant ClinGen Allele Registry | CA396457680 (s'ouvre dans un nouvel onglet) |
| Nom ClinVar | NM_004360.5(CDH1):c.467G>A (p.Trp156Ter) |
CDH1 c.467G>A dans d'autres bases de données
Rapport analysant ce variant (1)
Ces rapports sur des affections de Genome Test incluent c.467G>A parmi les variants analysés.
| Rapport | Affections | Mode de transmission |
|---|---|---|
| Hereditary Diffuse Gastric Cancer | CDH1-related diffuse gastric and lobular breast cancer syndrome | Autosomique dominant |
Autres variants dans CDH1
- A530Cfs*7Pathogène3 étoiles sur 4
- A546Lfs*11Pathogène3 étoiles sur 4
- c.1A>GPathogène3 étoiles sur 4
- c.2T>APathogène3 étoiles sur 4
- c.2T>CPathogène3 étoiles sur 4
- c.2T>GPathogène3 étoiles sur 4
- c.3G>APathogène3 étoiles sur 4
- c.11G>APathogène3 étoiles sur 4
- c.48+1G>APathogène3 étoiles sur 4
- c.49-2A>GPathogène3 étoiles sur 4
Limites
Cette page décrit des informations publiques sur un variant génétique. Il ne s'agit pas d'un diagnostic, et elle ne dit rien quant à la présence de ce variant chez vous ou chez quiconque.
Les classifications proviennent de ClinVar et évoluent à mesure que de nouvelles données sont examinées. La classification affichée ici peut différer de celle qui figure aujourd'hui dans ClinVar, ou de celle indiquée par un laboratoire.
Le séquençage du génome entier par lectures courtes peut manquer ou mal identifier certains variants, en particulier dans les régions d'ADN répétées ou très semblables, ainsi que dans les grandes insertions, délétions ou réarrangements.
Si vous avez des questions au sujet d'un variant figurant dans vos résultats ou dans ceux de votre famille, parlez-en à un conseiller en génétique ou à votre médecin.
Sources et crédits
- Classifications issues de ClinVar (version 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Termes relatifs aux maladies issus de la Mondo Disease Ontology (version 2026-10-06), utilisés selon la licence CC BY 4.0.
- Symboles et noms de gènes issus du HUGO Gene Nomenclature Committee (version 2026-10-16).
- Identifiants d'allèles issus du ClinGen Allele Registry (version 2026-10-16-c4908f54).
- Identifiants SNP de référence issus de dbSNP (version b157), National Center for Biotechnology Information.
- Liens entre gènes et maladies issus du Gene Curation Coalition, GenCC (version 2026-10-16).
- Régions difficiles issues du Genome in a Bottle Consortium (version v3.6).
- Transcrits issus de MANE (version v1.5), NCBI et EMBL-EBI.
- Conséquences prédites issues de mehari (version 0.11.0), avec les modèles de transcrits issus de cdot.
- Établi à partir des données Dante Labs, version 2026.10.16-c6eea6bf du 16 octobre 2026.
Citer cette page
Dante Labs. (16 octobre 2026). CDH1 c.467G>A (rs1555515215) (Version 2026.10.16-c6eea6bf). Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/genes/cdh1/variants/c-467g-a
Dante Labs. CDH1 c.467G>A (rs1555515215) [Internet]. Version 2026.10.16-c6eea6bf. 16 octobre 2026 [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à l'adresse : https://dantelabs.com/genes/cdh1/variants/c-467g-a
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