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Gène

CCR5AS

CCR5 antisense RNA

Résumé

Localisation cytogénétique
3p21.31
Coordonnées
Chromosome 3 : 46 363 984–46 407 066 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 43,1 kb
Transcrit MANE Select
ENST00000451485.3NR_125406.2
Type de locus
ARN long non codant (lncARN)

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CCR5AS. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CCR5AS

  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de CCR5AS. CCR5AS et 22 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 45 885 525 à 46 885 524.Chromosome 33p21.31p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2946 Mb46,2 Mb46,4 Mb46,6 Mb46,8 MbLZTFL1 : 45 823 316–45 916 042, brin inverseLZTFL1CCR9 : 45 884 425–45 904 311, brin directCCR9FYCO1 : 45 917 903–45 995 845, brin inverseFYCO1CXCR6 : 45 940 915–45 948 640, brin directCXCR6XCR1 : 46 016 988–46 085 850, brin inverseXCR1CCR3 : 46 130 890–46 266 717, brin directCCR3CCR1 : 46 201 709–46 208 676, brin inverseCCR1CCR2 : 46 353 864–46 360 940, brin directCCR2CCR5AS : 46 363 984–46 407 066, brin inverseCCR5ASCCR5 : 46 370 939–46 377 528, brin directCCR5CCRL2 : 46 407 144–46 412 997, brin directCCRL2LTF : 46 434 347–46 485 234, brin inverseLTFRTP3 : 46 494 611–46 501 506, brin directRTP3LRRC2 : 46 510 358–46 607 097, brin inverseLRRC2CRIPTO : 46 573 633–46 584 684, brin directCRIPTO : 46 581 150–46 617 226, brin directFAM240A : 46 612 525–46 626 543, brin directFAM240AALS2CL : 46 668 994–46 694 071, brin inverseALS2CLTMIE : 46 694 528–46 710 886, brin directTMIE : 46 712 115–46 812 574, brin inversePRSS50 : 46 712 117–46 717 869, brin inversePRSS50MYL3 : 46 835 109–46 885 911, brin inverseMYL3PTH1R : 46 877 706–46 903 799, brin directPTH1RSchéma de CCR5AS : 4 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 4 : 46 363 984–46 365 045, 1 062 basesExon 3 : 46 371 244–46 371 417, 174 basesExon 2 : 46 392 825–46 393 052, 228 basesExon 1 : 46 406 897–46 407 066, 170 bases43215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,6 kb sur les 43,1 kb du gène.

Séquençage de CCR5AS

1Faible

Difficulté de séquençage de CCR5AS avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions4 %
  • Teneur en GC0 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CCR5AS : CCR5 antisense RNA. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ccr5as

Vancouver

Dante Labs. Gène CCR5AS : CCR5 antisense RNA [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ccr5as

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