Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

CCR5AS

CCR5 antisense RNA

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
3p21.31
Koordináták
3. kromoszóma: 46 363 984–46 407 066 (GRCh38)
Exonok
4 exon, összesen 43,1 kb
MANE Select transzkriptum
ENST00000451485.3NR_125406.2
Lokusz típusa
Hosszú nem kódoló RNS (lncRNS)

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) CCR5AS gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A CCR5AS felépítése

  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
3. kromoszóma, a CCR5AS helyét zárójel jelöli. A CCR5AS és környékén 22 gén a 3. kromoszómán, 45 885 525–46 885 524 között.3. kromoszóma3p21.31p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2946 Mb46,2 Mb46,4 Mb46,6 Mb46,8 MbLZTFL1: 45 823 316–45 916 042, fordított szálLZTFL1CCR9: 45 884 425–45 904 311, előre szálCCR9FYCO1: 45 917 903–45 995 845, fordított szálFYCO1CXCR6: 45 940 915–45 948 640, előre szálCXCR6XCR1: 46 016 988–46 085 850, fordított szálXCR1CCR3: 46 130 890–46 266 717, előre szálCCR3CCR1: 46 201 709–46 208 676, fordított szálCCR1CCR2: 46 353 864–46 360 940, előre szálCCR2CCR5AS: 46 363 984–46 407 066, fordított szálCCR5ASCCR5: 46 370 939–46 377 528, előre szálCCR5CCRL2: 46 407 144–46 412 997, előre szálCCRL2LTF: 46 434 347–46 485 234, fordított szálLTFRTP3: 46 494 611–46 501 506, előre szálRTP3LRRC2: 46 510 358–46 607 097, fordított szálLRRC2CRIPTO: 46 573 633–46 584 684, előre szálCRIPTO: 46 581 150–46 617 226, előre szálFAM240A: 46 612 525–46 626 543, előre szálFAM240AALS2CL: 46 668 994–46 694 071, fordított szálALS2CLTMIE: 46 694 528–46 710 886, előre szálTMIE: 46 712 115–46 812 574, fordított szálPRSS50: 46 712 117–46 717 869, fordított szálPRSS50MYL3: 46 835 109–46 885 911, fordított szálMYL3PTH1R: 46 877 706–46 903 799, előre szálPTH1RA CCR5AS ábrája: 4 exon a(z) 3. kromoszóma fordított szálán4. exon: 46 363 984–46 365 045, 1062 bázis3. exon: 46 371 244–46 371 417, 174 bázis2. exon: 46 392 825–46 393 052, 228 bázis1. exon: 46 406 897–46 407 066, 170 bázis43215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 43,1 kb-jából 1,6 kb-ot tesznek ki.

CCR5AS szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a CCR5AS rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A CCR5AS exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a CCR5AS exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések4%
  • GC-tartalom0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). CCR5AS gén: CCR5 antisense RNA. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ccr5as

Vancouver

Dante Labs. CCR5AS gén: CCR5 antisense RNA [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ccr5as

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet