Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

WIPI1

WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
17q24.2
Koordinaatit
Kromosomi 17: 68 421 281–68 457 496 (GRCh38)
Eksonit
13 eksonia 36,2 kb:n alueella
Proteiini
446 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
FLJ10055, WIPI49, ATG18, ATG18A
MANE Select -transkripti
ENST00000262139.10NM_017983.7
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä WIPI1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

WIPI1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 17, jossa hakasulke osoittaa WIPI1-geenin sijainnin. WIPI1 ja 9 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 17, välillä 67 939 389–68 939 388.Kromosomi 1717q24.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.368 Mb68,2 Mb68,4 Mb68,6 Mb68,8 MbBPTF: 67 825 488–67 984 378, juoste eteenpäinBPTFC17orf58: 67 991 099–67 996 473, juoste taaksepäinC17orf58KPNA2: 68 035 517–68 047 364, juoste eteenpäinKPNA2AMZ2: 68 205 431–68 258 828, juoste eteenpäinAMZ2ARSG: 68 259 170–68 422 731, juoste eteenpäinARSGSLC16A6: 68 267 026–68 291 267, juoste taaksepäinSLC16A6WIPI1: 68 421 281–68 457 496, juoste taaksepäinWIPI1PRKAR1A: 68 511 740–68 551 319, juoste eteenpäinPRKAR1AFAM20A: 68 535 113–68 601 407, juoste taaksepäinFAM20AABCA8: 68 866 052–68 955 470, juoste taaksepäinABCA8WIPI1-kaavio: 13 eksonia kromosomin 17 juosteella, taaksepäinEkson 13: 68 421 281–68 421 820, 540 emästäEkson 12: 68 426 075–68 426 175, 101 emästäEkson 11: 68 427 135–68 427 253, 119 emästäEkson 10: 68 428 829–68 428 936, 108 emästäEkson 9: 68 429 996–68 430 160, 165 emästäEkson 8: 68 433 468–68 433 575, 108 emästäEkson 7: 68 434 556–68 434 626, 71 emästäEkson 6: 68 435 620–68 435 712, 93 emästäEkson 5: 68 436 382–68 436 479, 98 emästäEkson 4: 68 444 493–68 444 589, 97 emästäEkson 3: 68 450 728–68 450 897, 170 emästäEkson 2: 68 452 910–68 452 992, 83 emästäEkson 1: 68 457 342–68 457 496, 155 emästä131211109876543215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 1,9 kb geenin 36,2 kb:stä; 1 341 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

WIPI1-geenin sekvensointi

1Helppo

Kuinka vaikea WIPI1-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki WIPI1-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa WIPI1-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot0 %
  • GC-pitoisuus12 %
  • Referenssin peittävyys0 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). WIPI1-geeni: WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/wipi1

Vancouver

Dante Labs. WIPI1-geeni: WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/wipi1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test