Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

WDTC1

WD and tetratricopeptide repeats 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
1p36.11
Koordinaatit
Kromosomi 1: 27 234 632–27 308 636 (GRCh38)
Eksonit
16 eksonia 74 kb:n alueella
Proteiini
677 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
KIAA1037, ADP, DCAF9
MANE Select -transkripti
ENST00000319394.8NM_001276252.2
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä WDTC1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

WDTC1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 1, jossa hakasulke osoittaa WDTC1-geenin sijainnin. WDTC1 ja 23 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 1, välillä 26 771 634–27 771 633.Kromosomi 11p36.11p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4426,8 Mb27 Mb27,2 Mb27,4 Mb27,6 MbARID1A: 26 693 236–26 782 104, juoste eteenpäinARID1APIGV: 26 787 054–26 800 659, juoste eteenpäinPIGVZDHHC18: 26 826 668–26 857 604, juoste eteenpäinZDHHC18SFN: 26 863 149–26 864 456, juoste eteenpäinSFNGPN2: 26 876 132–26 890 283, juoste taaksepäinGPN2GPATCH3: 26 890 488–26 900 478, juoste taaksepäinGPATCH3NUDC: 26 900 238–26 946 886, juoste eteenpäinNUDCNR0B2: 26 911 484–26 914 073, juoste taaksepäinNR0B2KDF1: 26 949 556–26 960 788, juoste taaksepäinKDF1TRNP1: 26 993 649–27 002 812, juoste eteenpäinTRNP1TENT5B: 27 000 133–27 012 884, juoste taaksepäinTENT5BSLC9A1: 27 098 809–27 166 981, juoste taaksepäinSLC9A1WDTC1: 27 234 632–27 308 636, juoste eteenpäinWDTC1TMEM222: 27 322 139–27 336 401, juoste eteenpäinTMEM222SYTL1: 27 342 009–27 353 937, juoste eteenpäinSYTL1MAP3K6: 27 355 179–27 366 986, juoste taaksepäinMAP3K6FCN3: 27 369 108–27 374 920, juoste taaksepäinFCN3CD164L2: 27 379 176–27 383 339, juoste taaksepäinGPR3: 27 392 614–27 395 814, juoste eteenpäinGPR3WASF2: 27 404 226–27 490 308, juoste taaksepäinWASF2AHDC1: 27 534 035–27 604 431, juoste taaksepäinAHDC1FGR: 27 611 388–27 635 565, juoste taaksepäinFGRIFI6: 27 666 064–27 672 212, juoste taaksepäinIFI6FAM76A: 27 725 946–27 763 118, juoste eteenpäinFAM76AWDTC1-kaavio: 16 eksonia kromosomin 1 juosteella, eteenpäinEkson 1: 27 234 632–27 234 951, 320 emästäEkson 2: 27 260 956–27 261 102, 147 emästäEkson 3: 27 263 152–27 263 235, 84 emästäEkson 4: 27 282 239–27 282 285, 47 emästäEkson 5: 27 283 338–27 283 449, 112 emästäEkson 6: 27 287 674–27 287 861, 188 emästäEkson 7: 27 292 215–27 292 397, 183 emästäEkson 8: 27 294 022–27 294 116, 95 emästäEkson 9: 27 294 514–27 294 629, 116 emästäEkson 10: 27 296 326–27 296 401, 76 emästäEkson 11: 27 297 048–27 297 156, 109 emästäEkson 12: 27 297 938–27 298 111, 174 emästäEkson 13: 27 301 226–27 301 461, 236 emästäEkson 14: 27 303 621–27 303 795, 175 emästäEkson 15: 27 305 001–27 305 193, 193 emästäEkson 16: 27 306 186–27 308 636, 2 451 emästä151015165′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,7 kb geenin 74 kb:stä; 2 034 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

WDTC1-geenin sekvensointi

5Helppo

Kuinka vaikea WDTC1-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki WDTC1-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa WDTC1-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenssin peittävyys0 %
  • Toistot8,6 %
  • GC-pitoisuus12 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). WDTC1-geeni: WD and tetratricopeptide repeats 1. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/wdtc1

Vancouver

Dante Labs. WDTC1-geeni: WD and tetratricopeptide repeats 1 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/wdtc1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test