Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

TM4SF18

transmembrane 4 L six family member 18

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
3q25.1
Koordinaatit
Kromosomi 3: 149 318 498–149 333 636 (GRCh38)
Eksonit
6 eksonia 15,1 kb:n alueella
Proteiini
201 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
L6D
MANE Select -transkripti
ENST00000296059.7NM_138786.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä TM4SF18. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

TM4SF18-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 3, jossa hakasulke osoittaa TM4SF18-geenin sijainnin. TM4SF18 ja 12 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 3, välillä 148 826 067–149 826 066.Kromosomi 33q25.1p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29149 Mb149,2 Mb149,4 Mb149,6 Mb149,8 MbCPB1: 148 791 102–148 860 187, juoste eteenpäinCPB1CPA3: 148 865 278–148 898 572, juoste eteenpäinCPA3GYG1: 148 991 332–149 031 775, juoste eteenpäinGYG1HLTF: 149 030 064–149 086 559, juoste taaksepäinHLTFHPS3: 149 129 602–149 173 732, juoste eteenpäinHPS3CP: 149 162 410–149 222 049, juoste taaksepäinCPTM4SF18: 149 318 498–149 333 636, juoste taaksepäinTM4SF18TM4SF1: 149 369 022–149 377 729, juoste taaksepäinTM4SF1TM4SF4: 149 473 937–149 503 394, juoste eteenpäinTM4SF4WWTR1: 149 517 235–149 736 714, juoste taaksepäinWWTR1COMMD2: 149 733 246–149 752 495, juoste taaksepäinCOMMD2ANKUB1: 149 759 044–149 968 385, juoste taaksepäinANKUB1RNF13: 149 809 445–150 032 337, juoste eteenpäinRNF13TM4SF18-kaavio: 6 eksonia kromosomin 3 juosteella, taaksepäinEkson 6: 149 318 498–149 321 492, 2 995 emästäEkson 5: 149 322 256–149 322 436, 181 emästäEkson 4: 149 324 880–149 325 022, 143 emästäEkson 3: 149 330 330–149 330 419, 90 emästäEkson 2: 149 333 206–149 333 399, 194 emästäEkson 1: 149 333 513–149 333 636, 124 emästä6543215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 3,7 kb geenin 15,1 kb:stä; 606 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

TM4SF18-geenin sekvensointi

1Helppo

Kuinka vaikea TM4SF18-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki TM4SF18-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa TM4SF18-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot2,8 %
  • GC-pitoisuus8,7 %
  • Referenssin peittävyys0 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). TM4SF18-geeni: transmembrane 4 L six family member 18. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tm4sf18

Vancouver

Dante Labs. TM4SF18-geeni: transmembrane 4 L six family member 18 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tm4sf18

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test