Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

TM4SF18

transmembrane 4 L six family member 18

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
3q25.1
Koordináták
3. kromoszóma: 149 318 498–149 333 636 (GRCh38)
Exonok
6 exon, összesen 15,1 kb
Fehérje
201 aminosav
Más néven ismert
L6D
MANE Select transzkriptum
ENST00000296059.7NM_138786.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) TM4SF18 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A TM4SF18 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
3. kromoszóma, a TM4SF18 helyét zárójel jelöli. A TM4SF18 és környékén 12 gén a 3. kromoszómán, 148 826 067–149 826 066 között.3. kromoszóma3q25.1p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29149 Mb149,2 Mb149,4 Mb149,6 Mb149,8 MbCPB1: 148 791 102–148 860 187, előre szálCPB1CPA3: 148 865 278–148 898 572, előre szálCPA3GYG1: 148 991 332–149 031 775, előre szálGYG1HLTF: 149 030 064–149 086 559, fordított szálHLTFHPS3: 149 129 602–149 173 732, előre szálHPS3CP: 149 162 410–149 222 049, fordított szálCPTM4SF18: 149 318 498–149 333 636, fordított szálTM4SF18TM4SF1: 149 369 022–149 377 729, fordított szálTM4SF1TM4SF4: 149 473 937–149 503 394, előre szálTM4SF4WWTR1: 149 517 235–149 736 714, fordított szálWWTR1COMMD2: 149 733 246–149 752 495, fordított szálCOMMD2ANKUB1: 149 759 044–149 968 385, fordított szálANKUB1RNF13: 149 809 445–150 032 337, előre szálRNF13A TM4SF18 ábrája: 6 exon a(z) 3. kromoszóma fordított szálán6. exon: 149 318 498–149 321 492, 2995 bázis5. exon: 149 322 256–149 322 436, 181 bázis4. exon: 149 324 880–149 325 022, 143 bázis3. exon: 149 330 330–149 330 419, 90 bázis2. exon: 149 333 206–149 333 399, 194 bázis1. exon: 149 333 513–149 333 636, 124 bázis6543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 15,1 kb-jából 3,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 606 bázis kódolja a fehérjét.

TM4SF18 szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a TM4SF18 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A TM4SF18 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a TM4SF18 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések2,8%
  • GC-tartalom8,7%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). TM4SF18 gén: transmembrane 4 L six family member 18. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/tm4sf18

Vancouver

Dante Labs. TM4SF18 gén: transmembrane 4 L six family member 18 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/tm4sf18

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet