Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

SLC23A1

solute carrier family 23 member 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
5q31.2
Koordinaatit
Kromosomi 5: 139 367 196–139 383 297 (GRCh38)
Eksonit
15 eksonia 16,1 kb:n alueella
Proteiini
598 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
YSPL3, SVCT1
Aiemmat symbolit
SLC23A2
MANE Select -transkripti
ENST00000348729.8NM_005847.5
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SLC23A1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

SLC23A1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 5, jossa hakasulke osoittaa SLC23A1-geenin sijainnin. SLC23A1 ja 17 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 5, välillä 138 875 247–139 875 246.Kromosomi 55q31.2p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3139 Mb139,2 Mb139,4 Mb139,6 Mb139,8 MbCTNNA1: 138 610 967–138 935 039, juoste eteenpäinCTNNA1LRRTM2: 138 868 921–138 875 383, juoste taaksepäinLRRTM2SIL1: 138 886 914–139 293 557, juoste taaksepäinSIL1MATR3: 139 273 752–139 332 518, juoste eteenpäinMATR3PAIP2: 139 341 587–139 369 733, juoste eteenpäinPAIP2SLC23A1: 139 367 196–139 383 297, juoste taaksepäinSLC23A1MZB1: 139 387 467–139 390 081, juoste taaksepäinMZB1PROB1: 139 390 592–139 395 104, juoste taaksepäinPROB1SPATA24: 139 396 563–139 404 094, juoste taaksepäinDNAJC18: 139 408 588–139 444 491, juoste taaksepäin: 139 442 316–139 462 707, juoste taaksepäinECSCR: 139 446 541–139 462 751, juoste taaksepäinECSCRSMIM33: 139 471 004–139 474 650, juoste eteenpäinSMIM33STING1: 139 475 528–139 482 935, juoste taaksepäinUBE2D2: 139 526 431–139 633 291, juoste eteenpäinUBE2D2CXXC5: 139 646 375–139 683 882, juoste eteenpäinCXXC5PSD2: 139 795 606–139 844 470, juoste eteenpäinPSD2NRG2: 139 846 779–140 043 328, juoste taaksepäinNRG2SLC23A1-kaavio: 15 eksonia kromosomin 5 juosteella, taaksepäinEkson 15: 139 367 196–139 367 631, 436 emästäEkson 14: 139 371 987–139 372 253, 267 emästäEkson 13: 139 377 402–139 377 497, 96 emästäEkson 12: 139 377 975–139 378 118, 144 emästäEkson 11: 139 378 222–139 378 351, 130 emästäEkson 10: 139 378 579–139 378 684, 106 emästäEkson 9: 139 379 207–139 379 354, 148 emästäEkson 8: 139 379 678–139 379 834, 157 emästäEkson 7: 139 379 956–139 380 076, 121 emästäEkson 6: 139 380 208–139 380 389, 182 emästäEkson 5: 139 380 565–139 380 632, 68 emästäEkson 4: 139 380 798–139 380 886, 89 emästäEkson 3: 139 381 892–139 382 049, 158 emästäEkson 2: 139 382 492–139 382 605, 114 emästäEkson 1: 139 383 218–139 383 297, 80 emästä15141210864215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,3 kb geenin 16,1 kb:stä; 1 797 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: SLC23A1

1Helppo

Kuinka vaikea SLC23A1 on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Lähes kaikki geenin SLC23A1 eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa: geenin SLC23A1 eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot2,6 %
  • GC-pitoisuus11 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). SLC23A1-geeni: solute carrier family 23 member 1. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/slc23a1

Vancouver

Dante Labs. SLC23A1-geeni: solute carrier family 23 member 1 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/slc23a1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test