Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

SLC23A1

solute carrier family 23 member 1

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
5q31.2
Koordinater
Kromosom 5: 139 367 196–139 383 297 (GRCh38)
Eksoner
15 eksoner over 16,1 kb
Protein
598 aminosyrer
Også kjent som
YSPL3, SVCT1
Tidligere symboler
SLC23A2
MANE Select-transkripsjon
ENST00000348729.8NM_005847.5
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser SLC23A1 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er SLC23A1 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 5, med en parentes der SLC23A1 står. SLC23A1 og 17 gener i nærheten på kromosom 5, fra 138 875 247 til 139 875 246.Kromosom 55q31.2p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3139 Mb139,2 Mb139,4 Mb139,6 Mb139,8 MbCTNNA1: 138 610 967–138 935 039, fremover-strengCTNNA1LRRTM2: 138 868 921–138 875 383, bakover-strengLRRTM2SIL1: 138 886 914–139 293 557, bakover-strengSIL1MATR3: 139 273 752–139 332 518, fremover-strengMATR3PAIP2: 139 341 587–139 369 733, fremover-strengPAIP2SLC23A1: 139 367 196–139 383 297, bakover-strengSLC23A1MZB1: 139 387 467–139 390 081, bakover-strengMZB1PROB1: 139 390 592–139 395 104, bakover-strengPROB1SPATA24: 139 396 563–139 404 094, bakover-strengDNAJC18: 139 408 588–139 444 491, bakover-streng: 139 442 316–139 462 707, bakover-strengECSCR: 139 446 541–139 462 751, bakover-strengECSCRSMIM33: 139 471 004–139 474 650, fremover-strengSMIM33STING1: 139 475 528–139 482 935, bakover-strengUBE2D2: 139 526 431–139 633 291, fremover-strengUBE2D2CXXC5: 139 646 375–139 683 882, fremover-strengCXXC5PSD2: 139 795 606–139 844 470, fremover-strengPSD2NRG2: 139 846 779–140 043 328, bakover-strengNRG2Diagram av SLC23A1: 15 eksoner på bakover-strengen til kromosom 5Ekson 15: 139 367 196–139 367 631, 436 baserEkson 14: 139 371 987–139 372 253, 267 baserEkson 13: 139 377 402–139 377 497, 96 baserEkson 12: 139 377 975–139 378 118, 144 baserEkson 11: 139 378 222–139 378 351, 130 baserEkson 10: 139 378 579–139 378 684, 106 baserEkson 9: 139 379 207–139 379 354, 148 baserEkson 8: 139 379 678–139 379 834, 157 baserEkson 7: 139 379 956–139 380 076, 121 baserEkson 6: 139 380 208–139 380 389, 182 baserEkson 5: 139 380 565–139 380 632, 68 baserEkson 4: 139 380 798–139 380 886, 89 baserEkson 3: 139 381 892–139 382 049, 158 baserEkson 2: 139 382 492–139 382 605, 114 baserEkson 1: 139 383 218–139 383 297, 80 baser15141210864215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 2,3 kb av genets 16,1 kb, og 1 797 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av SLC23A1

1Lett

Hvor vanskelig SLC23A1 er å sekvensere med korte leser, av 100

Nesten alle eksonene til SLC23A1 ligger der korte leser kartlegges godt.

Det som bidrar: andelen av eksonene til SLC23A1 i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Repetisjoner2,6 %
  • GC-innhold11 %
  • Referansedekning0 %

En Dante Labs-score basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). SLC23A1-genet: solute carrier family 23 member 1. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/slc23a1

Vancouver

Dante Labs. SLC23A1-genet: solute carrier family 23 member 1 [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/slc23a1

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test