Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

BACE1-AS

BACE1 antisense RNA

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
11q23.3
Koordinaatit
Kromosomi 11: 117 291 346–117 292 170 (GRCh38)
Eksonit
1 eksoni 0,8 kb:n alueella
Tunnetaan myös nimellä
FJ573250, NCRNA00177, BACE1-AS1
Aiemmat symbolit
BACE1AS
MANE Select -transkripti
ENST00000618857.3NR_037803.3
Lokustyyppi
Pitkä ei-koodaava RNA (lncRNA)

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä BACE1-AS. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

BACE1-AS-geenin rakenne

  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi 11, jossa hakasulke osoittaa BACE1-AS-geenin sijainnin. BACE1-AS ja 13 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 11, välillä 116 791 758–117 791 757.Kromosomi 1111q23.3p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25116,8 Mb117 Mb117,2 Mb117,4 Mb117,6 MbAPOA5: 116 789 014–116 793 026, juoste taaksepäinAPOA5APOA4: 116 820 700–116 823 427, juoste taaksepäinAPOA4APOC3: 116 827 019–116 835 254, juoste eteenpäinAPOC3APOA1: 116 834 677–116 842 065, juoste taaksepäinAPOA1SIK3: 116 843 402–117 098 463, juoste taaksepäinSIK3PAFAH1B2: 117 144 278–117 176 894, juoste eteenpäinPAFAH1B2SIDT2: 117 178 730–117 197 452, juoste eteenpäinSIDT2TAGLN: 117 197 509–117 207 464, juoste eteenpäinTAGLNPCSK7: 117 202 588–117 232 628, juoste taaksepäinPCSK7RNF214: 117 232 154–117 287 429, juoste eteenpäinRNF214BACE1: 117 285 232–117 316 291, juoste taaksepäinBACE1BACE1-AS: 117 291 346–117 292 170, juoste eteenpäinBACE1-ASCEP164: 117 314 557–117 413 616, juoste eteenpäinCEP164DSCAML1: 117 427 772–117 817 525, juoste taaksepäinDSCAML1BACE1-AS-kaavio: yksi ekson kromosomin 11 juosteella, eteenpäinEkson 1: 117 291 346–117 292 170, 825 emästä15′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 0,8 kb geenin 0,8 kb:stä.

BACE1-AS-geenin sekvensointi

0Helppo

Kuinka vaikea BACE1-AS-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki BACE1-AS-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa BACE1-AS-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot0,5 %
  • GC-pitoisuus0 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). BACE1-AS-geeni: BACE1 antisense RNA. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/bace1-as

Vancouver

Dante Labs. BACE1-AS-geeni: BACE1 antisense RNA [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/bace1-as

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test