Gene
BACE1-AS
BACE1 antisense RNA
- HGNC 37125↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000278768↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 100379571↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 11q23.3
- Coordinate
- Cromosoma 11: 117.291.346–117.292.170 (GRCh38)
- Esoni
- 1 esone su 0,8 kb
- Noto anche come
- FJ573250, NCRNA00177, BACE1-AS1
- Simboli precedenti
- BACE1AS
- Trascritto MANE Select
- ENST00000618857.3NR_037803.3
- Tipo di locus
- RNA lungo non codificante (lncRNA)
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Nessun report del Genome Test legge ancora BACE1-AS. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.
Struttura di BACE1-AS
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 0,8 kb dei 0,8 kb del gene.
Sequenziamento di BACE1-AS
0Bassa
Quanto è difficile sequenziare BACE1-AS con letture corte, su 100Ogni barra indica la quota di basi degli esoni di BACE1-AS che si trovano in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in una regione di questo tipo, 100 quando ogni base si trova in tutte.
- MappabilitàTratti in cui le letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quelle zone potrebbe mancare o essere errata. Peso 35%.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una stessa base ripetuta, su cui le letture tendono a scivolare e che potrebbero non essere coperte per intero. Peso 15%.0,5%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre con difficoltà. Peso 10%.0%
- Copertura di riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento vicine, dove non c'è una sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
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Dante Labs. (s.d.). Gene BACE1-AS: BACE1 antisense RNA. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/bace1-as
Dante Labs. Gene BACE1-AS: BACE1 antisense RNA [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/bace1-as
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