Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SPATA6L

spermatogenesis associated 6 like

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
9p24.2-p24.1
Koordinaadid
Kromosoom 9: 4 598 316–4 666 480 (GRCh38)
Eksonid
12 eksonit, ulatus 68,2 kb
Valk
392 aminohapet
Tuntud ka kui
FLJ10058
Varasemad tähised
C9orf68
MANE Select transkript
ENST00000682582.1NM_001353486.2
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SPATA6L veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SPATA6L on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 9, millel on sulg kohal, kus asub SPATA6L. SPATA6L ja sellele lähedal asuvad 8 geeni kromosoomil 9, vahemikus 4 132 398 kuni 5 132 397.Kromosoom 99p24.2-p24.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.34,2 Mb4,4 Mb4,6 Mb4,8 Mb5 MbGLIS3: 3 824 127–4 348 392, pöördne ahelGLIS3SLC1A1: 4 490 207–4 587 469, otsene ahelSLC1A1SPATA6L: 4 598 316–4 666 480, pöördne ahelSPATA6LPLPP6: 4 662 294–4 665 258, otsene ahelPLPP6CDC37L1: 4 679 556–4 708 399, otsene ahelCDC37L1AK3: 4 709 395–4 742 043, pöördne ahelAK3RCL1: 4 792 881–4 928 572, otsene ahelRCL1JAK2: 4 984 390–5 129 950, otsene ahelJAK2INSL6: 4 991 978–5 185 668, pöördne ahelINSL6SPATA6L skeem: 12 eksonit kromosoomi 9 pöördne ahelalEkson 12: 4 598 316–4 600 809, 2494 alustEkson 11: 4 604 179–4 604 269, 91 alustEkson 10: 4 605 347–4 605 440, 94 alustEkson 9: 4 617 923–4 618 110, 188 alustEkson 8: 4 618 864–4 618 898, 35 alustEkson 7: 4 622 408–4 622 510, 103 alustEkson 6: 4 625 327–4 625 566, 240 alustEkson 5: 4 629 091–4 629 168, 78 alustEkson 4: 4 635 275–4 635 399, 125 alustEkson 3: 4 656 041–4 656 089, 49 alustEkson 2: 4 661 899–4 662 036, 138 alustEkson 1: 4 666 212–4 666 480, 269 alust1210864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 3,9 kb kogupikkusega 68,2 kb; neist 1179 alust kodeerivad valku.

SPATA6L sekveneerimine

1Lihtne

Kui raske on geeni SPATA6L lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni SPATA6L eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni SPATA6L eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Kordused4,7%
  • GC-sisaldus4,3%
  • Referentsi katvus0%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SPATA6L geen: spermatogenesis associated 6 like. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/spata6l

Vancouver

Dante Labs. SPATA6L geen: spermatogenesis associated 6 like [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/spata6l

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test