Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SLC43A1

solute carrier family 43 member 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
11q12.1
Koordinaadid
Kromosoom 11: 57 484 534–57 515 702 (GRCh38)
Eksonid
15 eksonit, ulatus 31,2 kb
Valk
559 aminohapet
Tuntud ka kui
R00504, PB39
Varasemad tähised
POV1
MANE Select transkript
ENST00000278426.8NM_003627.6
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SLC43A1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SLC43A1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 11, millel on sulg kohal, kus asub SLC43A1. SLC43A1 ja sellele lähedal asuvad 24 geeni kromosoomil 11, vahemikus 57 000 118 kuni 58 000 117.Kromosoom 1111q12.1p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2557,2 Mb57,4 Mb57,6 Mb57,8 Mb58 MbLRRC55: 57 181 747–57 191 717, otsene ahelLRRC55APLNR: 57 233 577–57 237 250, pöördne ahelAPLNRCNOT12: 57 299 588–57 325 682, pöördne ahelCNOT12SSRP1: 57 325 982–57 335 952, pöördne ahelSSRP1P2RX3: 57 338 346–57 374 566, otsene ahelP2RX3PRG3: 57 376 769–57 381 150, pöördne ahelPRG3PRG2: 57 386 780–57 393 854, pöördne ahelPRG2: 57 387 365–57 424 059, pöördne ahelSLC43A3: 57 406 954–57 457 505, pöördne ahelSLC43A3RTN4RL2: 57 460 484–57 477 534, otsene ahelRTN4RL2SLC43A1: 57 484 534–57 515 702, pöördne ahelSLC43A1TIMM10: 57 524 761–57 531 031, pöördne ahelTIMM10SMTNL1: 57 537 575–57 550 618, otsene ahelSMTNL1UBE2L6: 57 551 656–57 568 284, pöördne ahelUBE2L6SERPING1: 57 597 387–57 619 246, otsene ahelSERPING1CLP1: 57 638 605–57 662 755, otsene ahelCLP1YPEL4: 57 645 087–57 649 944, pöördne ahelYPEL4ZDHHC5: 57 667 433–57 702 260, otsene ahelZDHHC5MED19: 57 703 710–57 712 348, pöördne ahelMED19TMX2: 57 712 365–57 742 987, otsene ahelTMX2: 57 712 582–57 818 431, otsene ahelSELENOH: 57 741 491–57 743 554, otsene ahelSELENOH: 57 741 779–57 804 771, otsene ahelBTBD18: 57 743 514–57 753 148, pöördne ahelBTBD18CTNND1: 57 753 243–57 819 546, otsene ahelSLC43A1 skeem: 15 eksonit kromosoomi 11 pöördne ahelalEkson 15: 57 484 534–57 485 242, 709 alustEkson 14: 57 487 095–57 487 218, 124 alustEkson 13: 57 488 916–57 488 989, 74 alustEkson 12: 57 489 251–57 489 392, 142 alustEkson 11: 57 491 224–57 491 362, 139 alustEkson 10: 57 491 591–57 491 626, 36 alustEkson 9: 57 491 716–57 491 862, 147 alustEkson 8: 57 493 993–57 494 171, 179 alustEkson 7: 57 496 031–57 496 164, 134 alustEkson 6: 57 497 753–57 497 845, 93 alustEkson 5: 57 500 779–57 500 855, 77 alustEkson 4: 57 500 988–57 501 043, 56 alustEkson 3: 57 501 152–57 501 329, 178 alustEkson 2: 57 513 958–57 514 124, 167 alustEkson 1: 57 515 444–57 515 702, 259 alust15141210864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,5 kb kogupikkusega 31,2 kb; neist 1680 alust kodeerivad valku.

SLC43A1 sekveneerimine

2Lihtne

Kui raske on geeni SLC43A1 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni SLC43A1 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni SLC43A1 eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Kordused0,7%
  • GC-sisaldus22%
  • Referentsi katvus0%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SLC43A1 geen: solute carrier family 43 member 1. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/slc43a1

Vancouver

Dante Labs. SLC43A1 geen: solute carrier family 43 member 1 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/slc43a1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test