Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SIGLEC6

sialic acid binding Ig like lectin 6

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
19q13.41
Koordinaadid
Kromosoom 19: 51 517 819–51 531 670 (GRCh38)
Eksonid
8 eksonit, ulatus 13,9 kb
Valk
453 aminohapet
Tuntud ka kui
OB-BP1, SIGLEC-6, CD327
Varasemad tähised
CD33L, CD33L1
MANE Select transkript
ENST00000425629.8NM_001245.7
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SIGLEC6 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SIGLEC6 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 19, millel on sulg kohal, kus asub SIGLEC6. SIGLEC6 ja sellele lähedal asuvad 35 geeni kromosoomil 19, vahemikus 51 024 745 kuni 52 024 744.Kromosoom 1919q13.41p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4351,2 Mb51,4 Mb51,6 Mb51,8 Mb52 MbKLK11: 51 022 216–51 028 060, pöördne ahelKLK11KLK12: 51 029 092–51 035 230, pöördne ahelKLK12KLK13: 51 055 625–51 065 801, pöördne ahelKLK13KLK14: 51 077 317–51 086 530, pöördne ahelKLK14CTU1: 51 095 343–51 108 426, pöördne ahelCTU1SIGLEC9: 51 124 871–51 141 053, otsene ahelSIGLEC9SIGLEC7: 51 142 288–51 153 702, otsene ahelSIGLEC7CD33: 51 217 033–51 243 860, otsene ahelCD33SIGLECL1: 51 246 348–51 269 330, otsene ahelSIGLECL1IGLON5: 51 311 639–51 330 891, otsene ahelIGLON5VSIG10L: 51 331 536–51 342 310, pöördne ahelETFB: 51 345 161–51 366 449, pöördne ahel: 51 350 373–51 368 099, pöördne ahelCLDND2: 51 367 098–51 369 003, pöördne ahelNKG7: 51 371 606–51 375 628, pöördne ahelNKG7LIM2: 51 379 909–51 388 264, pöördne ahelLIM2C19orf84: 51 388 289–51 390 610, pöördne ahelC19orf84SIGLEC10: 51 410 020–51 417 858, pöördne ahelSIGLEC10SIGLEC8: 51 450 847–51 458 474, pöördne ahelSIGLEC8CEACAM18: 51 478 539–51 491 301, otsene ahelCEACAM18SIGLEC12: 51 491 227–51 501 800, pöördne ahelSIGLEC12SIGLEC6: 51 517 819–51 531 670, pöördne ahelSIGLEC6ZNF175: 51 571 250–51 592 510, otsene ahelZNF175SIGLEC5: 51 610 948–51 630 401, pöördne ahelSIGLEC5SIGLEC14: 51 639 478–51 646 825, pöördne ahelSIGLEC14SPACA6: 51 688 346–51 712 387, otsene ahelSPACA6HAS1: 51 713 106–51 723 992, pöördne ahelHAS1FPR1: 51 742 725–51 804 115, pöördne ahelFPR1FPR2: 51 752 026–51 771 307, otsene ahelFPR2FPR3: 51 795 131–51 827 761, otsene ahelFPR3ZNF577: 51 804 816–51 890 950, pöördne ahelZNF577ZNF649: 51 888 539–51 905 057, pöördne ahelZNF649ZNF613: 51 927 147–51 948 759, otsene ahelZNF613ZNF350: 51 963 979–51 986 860, pöördne ahelZNF350ZNF615: 51 991 332–52 008 237, pöördne ahelZNF615ZNF614: 52 012 765–52 030 240, pöördne ahelZNF614SIGLEC6 skeem: 8 eksonit kromosoomi 19 pöördne ahelalEkson 8: 51 517 819–51 520 255, 2437 alustEkson 7: 51 527 747–51 527 828, 82 alustEkson 6: 51 528 160–51 528 253, 94 alustEkson 5: 51 529 724–51 529 981, 258 alustEkson 4: 51 530 437–51 530 484, 48 alustEkson 3: 51 530 681–51 530 959, 279 alustEkson 2: 51 531 160–51 531 519, 360 alustEkson 1: 51 531 582–51 531 670, 89 alust876543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 3,6 kb kogupikkusega 13,9 kb; neist 1362 alust kodeerivad valku.

SIGLEC6 sekveneerimine

7Lihtne

Kui raske on geeni SIGLEC6 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni SIGLEC6 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni SIGLEC6 eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus2,7%
  • Homoloogia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referentsi katvus0%
  • Kordused1,9%
  • GC-sisaldus20%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SIGLEC6 geen: sialic acid binding Ig like lectin 6. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/siglec6

Vancouver

Dante Labs. SIGLEC6 geen: sialic acid binding Ig like lectin 6 [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/siglec6

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test