Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

RPS4X

ribosomal protein S4 X-linked

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
Xq13.1
Koordinaadid
Kromosoom X: 72 272 042–72 277 248 (GRCh38)
Eksonid
7 eksonit, ulatus 5,2 kb
Valk
263 aminohapet
Tuntud ka kui
DXS306, CCG2, SCAR, SCR10, FLJ40595, RPS4, eS4
MANE Select transkript
ENST00000316084.10NM_001007.5
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni RPS4X veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas RPS4X on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom X, millel on sulg kohal, kus asub RPS4X. RPS4X ja sellele lähedal asuvad 8 geeni kromosoomil X, vahemikus 71 774 645 kuni 72 774 644.Kromosoom XXq13.1p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2871,8 Mb72 Mb72,2 Mb72,4 Mb72,6 MbNHSL2: 71 910 834–72 161 750, otsene ahelNHSL2RTL5: 72 127 110–72 131 915, pöördne ahelRTL5PIN4: 72 181 353–72 302 926, otsene ahelPIN4ERCC6L: 72 201 871–72 239 041, pöördne ahelERCC6LRPS4X: 72 272 042–72 277 248, pöördne ahelRPS4XCITED1: 72 301 638–72 309 652, pöördne ahelCITED1: 72 301 691–72 572 843, pöördne ahelHDAC8: 72 329 516–72 573 101, pöördne ahelHDAC8PHKA1: 72 578 814–72 714 332, pöördne ahelPHKA1RPS4X skeem: 7 eksonit kromosoomi X pöördne ahelalEkson 7: 72 272 042–72 272 772, 731 alustEkson 6: 72 273 232–72 273 389, 158 alustEkson 5: 72 273 801–72 273 972, 172 alustEkson 4: 72 275 053–72 275 150, 98 alustEkson 3: 72 275 544–72 275 724, 181 alustEkson 2: 72 276 157–72 276 234, 78 alustEkson 1: 72 277 193–72 277 248, 56 alust76543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,5 kb kogupikkusega 5,2 kb; neist 792 alust kodeerivad valku.

RPS4X sekveneerimine

1Lihtne

Kui raske on geeni RPS4X lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni RPS4X eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni RPS4X eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus0,7%
  • Homoloogia0%
  • Kordused1,4%
  • GC-sisaldus1%
  • Referentsi katvus0%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). RPS4X geen: ribosomal protein S4 X-linked. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/rps4x

Vancouver

Dante Labs. RPS4X geen: ribosomal protein S4 X-linked [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/rps4x

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test