Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

H1-1

H1.1 linker histone, cluster member

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
6p22.2
Koordinaadid
Kromosoom 6: 26 017 032–26 017 787 (GRCh38)
Eksonid
1 eksoon, ulatus 0,8 kb
Valk
215 aminohapet
Tuntud ka kui
H1.1, H1a
Varasemad tähised
H1F1, HIST1H1A
MANE Select transkript
ENST00000244573.5NM_005325.4
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni H1-1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas H1-1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
Kromosoom 6, millel on sulg kohal, kus asub H1-1. H1-1 ja sellele lähedal asuvad 49 geeni kromosoomil 6, vahemikus 25 517 410 kuni 26 517 409.Kromosoom 66p22.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2725,6 Mb25,8 Mb26 Mb26,2 Mb26,4 MbCARMIL1: 25 279 062–25 620 537, otsene ahelCARMIL1SCGN: 25 652 201–25 701 792, otsene ahelSCGN: 25 652 210–25 738 044, otsene ahelH2AC1: 25 723 397–25 726 562, pöördne ahelH2AC1H2BC1: 25 726 777–25 727 345, otsene ahelH2BC1SLC17A4: 25 753 300–25 783 316, otsene ahelSLC17A4SLC17A1: 25 781 532–25 832 067, pöördne ahelSLC17A1SLC17A3: 25 833 066–25 882 478, pöördne ahelSLC17A3SLC17A2: 25 906 892–25 930 815, pöördne ahelSLC17A2TRIM38: 25 962 693–25 991 231, otsene ahelH1-1: 26 017 032–26 017 787, pöördne ahelH1-1H3C1: 26 020 451–26 021 487, otsene ahelH3C1H4C1: 26 021 649–26 022 847, otsene ahelH4C1H4C2: 26 025 802–26 027 283, pöördne ahelH4C2H3C2: 26 028 850–26 032 102, pöördne ahelH2AC4: 26 033 092–26 033 618, pöördne ahelH2BC3: 26 042 771–26 043 713, pöördne ahelH3C3: 26 045 384–26 045 869, otsene ahelH1-2: 26 054 760–26 056 470, pöördne ahelH2BC4: 26 067 392–26 124 016, pöördne ahelH2BC4HFE: 26 087 226–26 098 343, otsene ahelHFEH4C3: 26 103 933–26 104 337, otsene ahelH4C3H1-6: 26 107 412–26 108 135, pöördne ahelH1-6H2AC6: 26 124 145–26 139 116, otsene ahelH1-4: 26 156 329–26 157 115, otsene ahelH1-4H2BC5: 26 158 122–26 171 349, otsene ahelH2BC5H2BC6: 26 172 059–26 184 655, otsene ahelH2BC6H4C4: 26 188 710–26 189 112, pöördne ahelH4C4H3C4: 26 195 164–26 197 286, pöördne ahel: 26 195 595–26 199 293, pöördne ahelH2AC7: 26 198 784–26 199 293, pöördne ahelH2BC7: 26 199 516–26 199 988, otsene ahelH4C5: 26 204 610–26 205 021, otsene ahelH2BC8: 26 214 570–26 217 252, pöördne ahelH2AC8: 26 216 921–26 218 515, otsene ahelH3C6: 26 224 179–26 227 476, otsene ahelH1-3: 26 234 212–26 234 987, pöördne ahelH1-3H4C6: 26 240 393–26 240 793, otsene ahelH4C6H4C7: 26 246 611–26 246 996, pöördne ahelH4C7H3C7: 26 250 142–26 250 635, pöördne ahelH2BC9: 26 251 614–26 252 075, otsene ahelH3C8: 26 270 918–26 271 413, pöördne ahelH2BC10: 26 272 931–26 273 412, otsene ahelH4C8: 26 277 609–26 285 638, pöördne ahelH4C8BTN3A2: 26 365 159–26 382 797, otsene ahelBTN3A2BTN2A2: 26 383 091–26 394 880, otsene ahelBTN2A2BTN3A1: 26 402 237–26 415 216, otsene ahelBTN3A1BTN3A3: 26 440 452–26 453 422, otsene ahelBTN3A3BTN2A1: 26 457 904–26 476 621, otsene ahelBTN2A1BTN1A1: 26 500 303–26 510 425, otsene ahelBTN1A1H1-1 skeem: üks eksoon kromosoomi 6 pöördne ahelalEkson 1: 26 017 032–26 017 787, 756 alust15′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 0,8 kb kogupikkusega 0,8 kb; neist 648 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: H1-1

1Lihtne

Kui raske on geeni H1-1 lühikeste lugemitega järjestada, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni H1-1 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Lisaks mõjutab tulemust see, kui suur osa geeni H1-1 eksonitest asub igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Ühine chrY-ga0%
  • Viitekatvus0%
  • Kordused2,8%
  • GC-sisaldus2,5%

Dante Labsi skoor, mis põhineb meie enda uuringul ja NISTi Genome in a Bottle kaartidel raskesti järjestatavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). H1-1 geen: H1.1 linker histone, cluster member. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/h1-1

Vancouver

Dante Labs. H1-1 geen: H1.1 linker histone, cluster member [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/h1-1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test