Gen
H1-1
H1.1 linker histone, cluster member
- HGNC 4715↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000124610↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 3024↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 6p22.2
- Coördinaten
- Chromosoom 6: 26.017.032–26.017.787 (GRCh38)
- Exons
- 1 exon over 0,8 kb
- Eiwit
- 215 aminozuren
- Ook bekend als
- H1.1, H1a
- Eerdere symbolen
- H1F1, HIST1H1A
- MANE Select-transcript
- ENST00000244573.5NM_005325.4
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/h1-1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees H1-1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geen enkel Genome Test-rapport leest H1-1 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.
Opbouw van H1-1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 0,8 kb van de 0,8 kb van het gen; 648 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van H1-1
1Laag
Hoe moeilijk H1-1 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100Elke balk is het aandeel van de exonbasen van H1-1 in dat type moeilijke regio. De score weegt deze naar hoeveel elk een short-read-call kost: 0 wanneer geen enkele base in een van deze regio's valt, 100 wanneer elke base in alle regio's valt.
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek geplaatst kunnen worden, waardoor een call daar kan ontbreken of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen schuiven en die ze mogelijk niet overbruggen. Gewicht 15%.2,8%
- GC-gehalteVensters onder 25% of boven 65% G en C, die de bibliotheekvoorbereiding slechts dun dekt. Gewicht 10%.2,5%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentieassemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Gewicht 10%.0%
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). H1-1-gen: H1.1 linker histone, cluster member. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/h1-1
Dante Labs. H1-1-gen: H1.1 linker histone, cluster member [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/h1-1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken