Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

COL21A1

collagen type XXI alpha 1 chain

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
6p12.1
Koordinaadid
Kromosoom 6: 56 056 590–56 247 580 (GRCh38)
Eksonid
30 eksonit, ulatus 191 kb
Valk
957 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000244728.10NM_030820.4
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni COL21A1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas COL21A1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 6, millel on sulg kohal, kus asub COL21A1. COL21A1 ja sellele lähedal asuvad 2 geeni kromosoomil 6, vahemikus 55 652 085 kuni 56 652 084.Kromosoom 66p12.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2755,8 Mb56 Mb56,2 Mb56,4 Mb56,6 MbBMP5: 55 753 619–55 875 601, pöördne ahelBMP5COL21A1: 56 056 590–56 247 580, pöördne ahelCOL21A1DST: 56 457 981–56 955 274, pöördne ahelDSTCOL21A1 skeem: 30 eksonit kromosoomi 6 pöördne ahelalEkson 30: 56 056 590–56 057 844, 1255 alustEkson 29: 56 059 165–56 059 242, 78 alustEkson 28: 56 060 018–56 060 218, 201 alustEkson 27: 56 060 741–56 060 795, 55 alustEkson 26: 56 060 891–56 061 037, 147 alustEkson 25: 56 061 649–56 061 681, 33 alustEkson 24: 56 064 578–56 064 622, 45 alustEkson 23: 56 067 295–56 067 330, 36 alustEkson 22: 56 069 046–56 069 117, 72 alustEkson 21: 56 070 745–56 070 798, 54 alustEkson 20: 56 074 232–56 074 285, 54 alustEkson 19: 56 075 479–56 075 532, 54 alustEkson 18: 56 077 529–56 077 573, 45 alustEkson 17: 56 101 472–56 101 525, 54 alustEkson 16: 56 124 062–56 124 115, 54 alustEkson 15: 56 124 239–56 124 292, 54 alustEkson 14: 56 125 567–56 125 620, 54 alustEkson 13: 56 126 096–56 126 149, 54 alustEkson 12: 56 141 785–56 141 838, 54 alustEkson 11: 56 141 930–56 141 983, 54 alustEkson 10: 56 156 887–56 156 949, 63 alustEkson 9: 56 164 423–56 164 506, 84 alustEkson 8: 56 164 814–56 164 822, 9 alustEkson 7: 56 166 906–56 166 983, 78 alustEkson 6: 56 168 124–56 168 297, 174 alustEkson 5: 56 170 649–56 170 865, 217 alustEkson 4: 56 170 960–56 171 128, 169 alustEkson 3: 56 179 578–56 180 129, 552 alustEkson 2: 56 182 531–56 182 656, 126 alustEkson 1: 56 247 387–56 247 580, 194 alust3025201510515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,2 kb kogupikkusega 191 kb; neist 2874 alust kodeerivad valku.

COL21A1 sekveneerimine

3Lihtne

Kui raske on geeni COL21A1 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni COL21A1 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni COL21A1 eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referentsi katvus0%
  • Kordused1,5%
  • GC-sisaldus13%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). COL21A1 geen: collagen type XXI alpha 1 chain. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/col21a1

Vancouver

Dante Labs. COL21A1 geen: collagen type XXI alpha 1 chain [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/col21a1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test