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Gène

COL21A1

collagen type XXI alpha 1 chain

Résumé

Localisation cytogénétique
6p12.1
Coordonnées
Chromosome 6 : 56 056 590–56 247 580 (GRCh38)
Exons
30 exons sur 191 kb
Protéine
957 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000244728.10NM_030820.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore COL21A1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de COL21A1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de COL21A1. COL21A1 et 2 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 55 652 085 à 56 652 084.Chromosome 66p12.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2755,8 Mb56 Mb56,2 Mb56,4 Mb56,6 MbBMP5 : 55 753 619–55 875 601, brin inverseBMP5COL21A1 : 56 056 590–56 247 580, brin inverseCOL21A1DST : 56 457 981–56 955 274, brin inverseDSTSchéma de COL21A1 : 30 exons sur le brin inverse du chromosome 6Exon 30 : 56 056 590–56 057 844, 1 255 basesExon 29 : 56 059 165–56 059 242, 78 basesExon 28 : 56 060 018–56 060 218, 201 basesExon 27 : 56 060 741–56 060 795, 55 basesExon 26 : 56 060 891–56 061 037, 147 basesExon 25 : 56 061 649–56 061 681, 33 basesExon 24 : 56 064 578–56 064 622, 45 basesExon 23 : 56 067 295–56 067 330, 36 basesExon 22 : 56 069 046–56 069 117, 72 basesExon 21 : 56 070 745–56 070 798, 54 basesExon 20 : 56 074 232–56 074 285, 54 basesExon 19 : 56 075 479–56 075 532, 54 basesExon 18 : 56 077 529–56 077 573, 45 basesExon 17 : 56 101 472–56 101 525, 54 basesExon 16 : 56 124 062–56 124 115, 54 basesExon 15 : 56 124 239–56 124 292, 54 basesExon 14 : 56 125 567–56 125 620, 54 basesExon 13 : 56 126 096–56 126 149, 54 basesExon 12 : 56 141 785–56 141 838, 54 basesExon 11 : 56 141 930–56 141 983, 54 basesExon 10 : 56 156 887–56 156 949, 63 basesExon 9 : 56 164 423–56 164 506, 84 basesExon 8 : 56 164 814–56 164 822, 9 basesExon 7 : 56 166 906–56 166 983, 78 basesExon 6 : 56 168 124–56 168 297, 174 basesExon 5 : 56 170 649–56 170 865, 217 basesExon 4 : 56 170 960–56 171 128, 169 basesExon 3 : 56 179 578–56 180 129, 552 basesExon 2 : 56 182 531–56 182 656, 126 basesExon 1 : 56 247 387–56 247 580, 194 bases3025201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,2 kb sur les 191 kb du gène ; 2 874 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène COL21A1 : collagen type XXI alpha 1 chain. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/col21a1

Vancouver

Dante Labs. Gène COL21A1 : collagen type XXI alpha 1 chain [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/col21a1

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