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Gene

COL21A1

collagen type XXI alpha 1 chain

Resumo

Localização citogenética
6p12.1
Coordenadas
Cromossoma 6: 56 056 590–56 247 580 (GRCh38)
Exões
30 exões ao longo de 191 kb
Proteína
957 aminoácidos
Transcrito MANE Select
ENST00000244728.10NM_030820.4
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa COL21A1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como COL21A1 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 6, com um parêntese onde se situa COL21A1. COL21A1 e 2 genes próximos no cromossoma 6, de 55 652 085 a 56 652 084.Cromossoma 66p12.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2755,8 Mb56 Mb56,2 Mb56,4 Mb56,6 MbBMP5: 55 753 619–55 875 601, fita inversaBMP5COL21A1: 56 056 590–56 247 580, fita inversaCOL21A1DST: 56 457 981–56 955 274, fita inversaDSTDiagrama de COL21A1: 30 exões na cadeia inversa do cromossoma 6Exão 30: 56 056 590–56 057 844, 1255 basesExão 29: 56 059 165–56 059 242, 78 basesExão 28: 56 060 018–56 060 218, 201 basesExão 27: 56 060 741–56 060 795, 55 basesExão 26: 56 060 891–56 061 037, 147 basesExão 25: 56 061 649–56 061 681, 33 basesExão 24: 56 064 578–56 064 622, 45 basesExão 23: 56 067 295–56 067 330, 36 basesExão 22: 56 069 046–56 069 117, 72 basesExão 21: 56 070 745–56 070 798, 54 basesExão 20: 56 074 232–56 074 285, 54 basesExão 19: 56 075 479–56 075 532, 54 basesExão 18: 56 077 529–56 077 573, 45 basesExão 17: 56 101 472–56 101 525, 54 basesExão 16: 56 124 062–56 124 115, 54 basesExão 15: 56 124 239–56 124 292, 54 basesExão 14: 56 125 567–56 125 620, 54 basesExão 13: 56 126 096–56 126 149, 54 basesExão 12: 56 141 785–56 141 838, 54 basesExão 11: 56 141 930–56 141 983, 54 basesExão 10: 56 156 887–56 156 949, 63 basesExão 9: 56 164 423–56 164 506, 84 basesExão 8: 56 164 814–56 164 822, 9 basesExão 7: 56 166 906–56 166 983, 78 basesExão 6: 56 168 124–56 168 297, 174 basesExão 5: 56 170 649–56 170 865, 217 basesExão 4: 56 170 960–56 171 128, 169 basesExão 3: 56 179 578–56 180 129, 552 basesExão 2: 56 182 531–56 182 656, 126 basesExão 1: 56 247 387–56 247 580, 194 bases3025201510515′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 4,2 kb dos 191 kb do gene; 2874 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de COL21A1

3Fácil

Dificuldade de sequenciação de COL21A1 com leituras curtas, em 100

Quase todos os exões de COL21A1 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.

O que acresce: a proporção dos exões de COL21A1 em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Shared with chrY0%
  • Cobertura da referência0%
  • Repetições1,5%
  • Conteúdo GC13%

Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene COL21A1: collagen type XXI alpha 1 chain. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/col21a1

Vancouver

Dante Labs. Gene COL21A1: collagen type XXI alpha 1 chain [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/col21a1

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