Cuando se hace un análisis de sangre, el resultado es una instantánea: preciso en ese momento, pero irrelevante un año después. Cuando se secuencia el genoma completo, el resultado es permanente. Su secuencia de ADN no cambia. Sin embargo, la ciencia que la interpreta sí evoluciona, y eso es lo que hace que la secuenciación del genoma completo sea fundamentalmente distinta de cualquier otra prueba de salud.
Sus datos son inmutables. La ciencia no.
Cada mes, investigadores de todo el mundo publican nuevos hallazgos que relacionan variantes genéticas con enfermedades, respuestas a medicamentos y problemas de salud. La base de datos ClinVar —el principal archivo público sobre las relaciones entre variantes y enfermedades— incorpora miles de nuevas entradas al año. El ritmo se acelera a medida que se dispone de conjuntos de datos genómicos más amplios para realizar análisis a escala poblacional.
Esto significa que una variante de su genoma que hoy se clasifica como «variante de significado incierto» (VUS) podría reclasificarse como patogénica el próximo año, cuando se hayan acumulado suficientes pruebas procedentes de estudios clínicos. Por el contrario, una variante que parecía preocupante podría reclasificarse en una categoría de menor riesgo a medida que se disponga de más datos poblacionales.
La pregunta clave es: ¿vuelve a analizar sus datos su proveedor de pruebas cuando se producen estas actualizaciones?
Por qué la mayoría de las pruebas se quedan ancladas en el tiempo
Las pruebas de genotipado para consumidores —como las que ofrecen 23andMe, AncestryDNA y otros servicios similares— analizan en un chip un conjunto preseleccionado de posiciones genéticas. El informe que usted recibe refleja lo que se sabía sobre esas posiciones concretas el día en que se diseñó el chip. Si la ciencia descubre algo nuevo sobre una variante que no estaba incluida en el chip, o reclasifica una que sí lo estaba, sus resultados no se actualizan, porque los datos subyacentes están incompletos.
Incluso algunas pruebas clínicas presentan esta limitación. Los paneles genéticos dirigidos analizan únicamente los genes incluidos en el panel. Si futuras investigaciones identificaran una variante clínicamente importante en un gen que no estuviera incluido en su panel, necesitaría una nueva prueba para detectarla.
Cómo funciona el reanálisis del genoma completo
La secuenciación del genoma completo analiza cada posición de su genoma, aproximadamente 6.400 millones de pares de bases. Esto significa que su archivo de datos está completo desde el primer día. No se omitió nada. No es necesario volver a recoger ninguna muestra.
Cuando se publiquen y validen clínicamente nuevas asociaciones entre variantes y enfermedades, los datos sin procesar de su secuenciación original podrán volver a analizarse utilizando bases de datos actualizadas. Así podrán detectarse nuevos hallazgos clínicamente significativos que no se conocían cuando se realizó la prueba original, sin necesidad de extraerle sangre ni de utilizar un kit nuevo o realizar una nueva prueba.
En Dante Labs, este nuevo análisis se realiza automáticamente a través de la plataforma Genome Manager. Cuando validamos nuevas asociaciones entre variantes y enfermedades mediante nuestro proceso de revisión clínica, sus informes se actualizan para reflejar los últimos avances científicos. Usted recibe una notificación de cualquier cambio clínicamente relevante.
Cómo funciona esto en la práctica
Veamos un ejemplo real: desde que ClinVar comenzó a hacer un seguimiento de las clasificaciones de variantes, aproximadamente el 7 % de todas las variantes clasificadas se han reclasificado al menos una vez a medida que surgían nuevas evidencias. Algunas variantes VUS pasaron a clasificarse como patogénicas. Otras variantes probablemente patogénicas se reclasificaron en una categoría de menor riesgo. Estas reclasificaciones tienen consecuencias clínicas directas: cambian si se recomienda realizar pruebas de detección, qué medicamentos son adecuados y a qué familiares se les deben realizar pruebas.
Con un conjunto completo de datos genómicos, estas reclasificaciones se aplican automáticamente a sus informes. Con un conjunto de datos incompleto —es decir, cualquier opción que no sea la secuenciación del genoma completo—, es posible que no se apliquen, ya sea porque no se analizó la variante pertinente o porque el proveedor no ofrece un nuevo análisis.
La rentabilidad de secuenciar una sola vez
También hay un argumento práctico. La secuenciación del genoma completo cuesta una fracción de lo que costaba hace cinco años, y la tendencia sigue siendo a la baja. Pero el cálculo no se limita al precio actual, sino que tiene en cuenta el coste total de la información genética a lo largo de toda la vida.
Si hoy se realiza una prueba de panel dirigida y el año que viene otra diferente —porque su pregunta clínica haya cambiado o porque se hayan añadido nuevos genes al panel—, estará pagando dos veces por obtener visiones incompletas del mismo genoma. La secuenciación del genoma completo lo captura todo de una sola vez. Cualquier pregunta futura podrá responderse a partir del mismo conjunto de datos.
La conclusión
Su genoma es la única prueba de salud que adquiere más valor después de realizarla. No porque su ADN cambie —no lo hace—, sino porque la ciencia que lo interpreta no deja de avanzar. El único requisito es que la prueba original haya capturado toda la información. Eso es exactamente lo que hace la secuenciación del genoma completo.