Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

C16orf54

chromosome 16 open reading frame 54

Shrnutí

Cytogenetická poloha
16p11.2
Souřadnice
Chromozom 16: 29 742 463–29 745 990 (GRCh38)
Exony
2 exonů na 3,5 kb
Protein
224 aminokyselin
Další názvy
FLJ35681, SAIL
Transkript MANE Select
ENST00000329410.4NM_175900.4
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen C16orf54. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je C16orf54 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
Chromozom 16, se závorkou u C16orf54. C16orf54 a 39 genů poblíž na chromozomu 16, od 29 244 227 do 30 244 226.Chromozom 1616p11.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.329,4 Mb29,6 Mb29,8 Mb30 Mb30,2 MbNPIPB11: 29 381 310–29 406 711, řetězec zpětnémNPIPB11BOLA2-SMG1P6: 29 443 230–29 454 651, řetězec zpětnémBOLA2: 29 453 587–29 455 012, řetězec zpětnémBOLA2SLX1B: 29 454 501–29 458 223, řetězec dopřednémSLX1BSULT1A4: 29 458 993–29 464 979, řetězec dopřednémSULT1A4NPIPB12: 29 483 534–29 508 595, řetězec zpětnémNPIPB12QPRT: 29 662 957–29 698 704, řetězec dopřednémQPRTSPN: 29 662 957–29 670 876, řetězec dopřednémSPNC16orf54: 29 742 463–29 745 990, řetězec zpětnémC16orf54ZG16: 29 760 591–29 783 885, řetězec dopřednémZG16KIF22: 29 790 137–29 805 388, řetězec dopřednémKIF22MAZ: 29 805 637–29 811 176, řetězec dopřednémMAZPRRT2: 29 811 382–29 815 892, řetězec dopřednémPRRT2: 29 812 261–29 820 092, řetězec dopřednémPAGR1: 29 816 086–29 822 489, řetězec dopředném: 29 817 239–29 830 627, řetězec dopřednémMVP: 29 820 394–29 848 039, řetězec dopřednémCDIPT: 29 857 474–29 863 414, řetězec zpětnémCDIPTSEZ6L2: 29 871 159–29 899 582, řetězec zpětnémSEZ6L2ASPHD1: 29 900 363–29 919 864, řetězec dopřednémASPHD1KCTD13: 29 903 877–29 926 236, řetězec zpětnémKCTD13TMEM219: 29 940 885–29 973 052, řetězec dopřednémTMEM219TAOK2: 29 973 675–29 992 262, řetězec dopřednémTAOK2HIRIP3: 29 992 314–29 996 126, řetězec zpětnémHIRIP3INO80E: 29 994 983–30 005 794, řetězec dopřednémINO80EDOC2A: 30 005 507–30 023 270, řetězec zpětnémFIMP1: 30 023 198–30 027 736, řetězec dopřednémTLCD3B: 30 024 425–30 052 978, řetězec zpětném: 30 053 101–30 071 526, řetězec dopřednémALDOA: 30 064 164–30 070 457, řetězec dopřednémALDOAPPP4C: 30 075 967–30 085 391, řetězec dopřednémPPP4CTBX6: 30 085 793–30 091 933, řetězec zpětnémTBX6YPEL3: 30 092 314–30 096 915, řetězec zpětnémGDPD3: 30 104 810–30 114 034, řetězec zpětnémMAPK3: 30 114 104–30 123 506, řetězec zpětnémCORO1A: 30 182 798–30 189 085, řetězec dopřednémCORO1ABOLA2B: 30 192 928–30 194 306, řetězec zpětnémBOLA2BSLX1A: 30 193 875–30 197 566, řetězec dopřednémSLX1ASULT1A3: 30 198 059–30 204 324, řetězec dopřednémSULT1A3NPIPB13: 30 222 893–30 255 268, řetězec zpětnémSchéma C16orf54: 2 exonů na zpětném řetězci chromozomu 16Exon 2: 29 742 463–29 744 951, 2 489 bázíExon 1: 29 745 911–29 745 990, 80 bází215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 2,6 kb z 3,5 kb genu; 675 těchto bází kódují protein.

Sekvenování C16orf54

7Snadné

Jak obtížně se C16orf54 sekvenuje krátkými čteními, ze 100

Téměř všechny exony genu C16orf54 leží tam, kde se krátká čtení mapují čistě.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu C16orf54 v každém druhu obtížné oblasti

  • Mapovatelnost0 %
  • Homologie0 %
  • Sdíleno s chrY0 %
  • Pokrytí referenční sekvence0 %
  • Repetice6,5 %
  • Obsah GC28 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, vycházející z map obtížně sekvenovatelných oblastí NIST Genome in a Bottle.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen C16orf54: chromosome 16 open reading frame 54. Staženo 21. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/c16orf54

Vancouver

Dante Labs. Gen C16orf54: chromosome 16 open reading frame 54 [Internet]. [citováno 21. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/c16orf54

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test