Gen
UBE2O
ubiquitin conjugating enzyme E2 O
- HGNC 29554↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000175931↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 63893↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 17q25.1
- Koordinater
- Kromosom 17: 76 389 456–76 453 152 (GRCh38)
- Exoner
- 18 exoner på 63,7 kb
- Protein
- 1 292 aminosyror
- Även känd som
- E2-230K
- MANE Select-transkript
- ENST00000319380.12NM_022066.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ube2o.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs UBE2O, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser UBE2O ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är UBE2O uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 5,4 kb av genens 63,7 kb, och 3 879 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av UBE2O
4Låg
Hur svår UBE2O är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av UBE2Os exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.5,2 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.27 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). UBE2O-genen: ubiquitin conjugating enzyme E2 O. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ube2o
Dante Labs. UBE2O-genen: ubiquitin conjugating enzyme E2 O [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ube2o
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor