Gen
CATSPERQ
catsper channel auxiliary subunit theta
- HGNC 44155↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000261587↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 340393↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 8q24.3
- Koordinater
- Kromosom 8: 144 353 228–144 354 931 (GRCh38)
- Exoner
- 6 exoner på 1,7 kb
- Protein
- 235 aminosyror
- Även känd som
- C8orfK29
- Tidigare symboler
- TMEM249
- MANE Select-transkript
- ENST00000696146.1NM_001280561.2
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/catsperq.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs CATSPERQ, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser CATSPERQ ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är CATSPERQ uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 0,9 kb av genens 1,7 kb, och 708 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av CATSPERQ
15Måttlig
Hur svår CATSPERQ är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Några av CATSPERQ:s exoner ligger där korta läsningar kan missa eller felplacera en förändring.
Det som adderar: andelen av CATSPERQ:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 100 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vikt 60 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 50 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 30 %.0,8 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 20 %.72 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av CATSPERQ:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). CATSPERQ-genen: catsper channel auxiliary subunit theta. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/catsperq
Dante Labs. CATSPERQ-genen: catsper channel auxiliary subunit theta [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/catsperq
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor