Gene
TPRG1L
tumor protein p63 regulated 1 like
- HGNC 27007↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000158109↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 127262↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 1p36.32
- Coordenadas
- Cromossoma 1: 3 625 015–3 630 127 (GRCh38)
- Exões
- 5 exões ao longo de 5,1 kb
- Proteína
- 272 aminoácidos
- Também conhecido como
- RP11-46F15.3, FLJ21811, TPRGL, SVAP30, h-Mover
- Símbolos anteriores
- FAM79A
- Transcrito MANE Select
- ENST00000378344.7NM_182752.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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page$gene$nameAnalise TPRG1L, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Como TPRG1L está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 2,4 kb dos 5,1 kb do gene; 819 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de TPRG1L
2Baixo
Grau de dificuldade de sequenciar TPRG1L com leituras curtas, em 100Cada barra é a proporção das bases de exões de TPRG1L que estão nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem para uma chamada de leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não abranger. Peso 15%.3,9%
- Teor de GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre mal. Peso 10%.15%
- Cobertura de referênciaLacunas na montagem de referência próxima, onde não há sequência à qual as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
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Dante Labs. (s.d.). Gene TPRG1L: tumor protein p63 regulated 1 like. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/tprg1l
Dante Labs. Gene TPRG1L: tumor protein p63 regulated 1 like [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/tprg1l
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