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Gene

RPS6KB1

ribosomal protein S6 kinase B1

Resumo

Localização citogenética
17q23.1
Coordenadas
Cromossoma 17: 59 893 121–59 950 574 (GRCh38)
Exões
15 exões ao longo de 57,5 kb
Proteína
525 aminoácidos
Também conhecido como
S6K1, p70(S6K)-alpha, PS6K, S6K
Símbolos anteriores
STK14A
Transcrito MANE Select
ENST00000225577.9NM_003161.4
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa RPS6KB1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como RPS6KB1 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 17, com um parêntese onde se situa RPS6KB1. RPS6KB1 e 11 genes próximos no cromossoma 17, de 59 421 848 a 60 421 847.Cromossoma 1717q23.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.359,6 Mb59,8 Mb60 Mb60,2 Mb60,4 MbDHX40: 59 565 558–59 611 563, fita diretaDHX40CLTC: 59 619 606–59 696 956, fita diretaCLTCPTRH2: 59 674 636–59 707 638, fita inversaPTRH2VMP1: 59 707 192–59 842 255, fita diretaVMP1TUBD1: 59 859 038–59 892 951, fita inversaTUBD1RPS6KB1: 59 893 121–59 950 574, fita diretaRPS6KB1RNFT1: 59 896 781–59 964 777, fita inversaRNFT1: 59 940 908–59 973 101, fita diretaHEATR6: 60 041 008–60 078 933, fita inversaHEATR6CA4: 60 147 838–60 178 085, fita diretaCA4USP32: 60 177 184–60 422 470, fita inversaUSP32CHCT1: 60 392 429–60 431 426, fita diretaCHCT1Diagrama de RPS6KB1: 15 exões na cadeia direta do cromossoma 17Exão 1: 59 893 121–59 893 325, 205 basesExão 2: 59 910 562–59 910 611, 50 basesExão 3: 59 912 684–59 912 804, 121 basesExão 4: 59 914 635–59 914 703, 69 basesExão 5: 59 926 435–59 926 582, 148 basesExão 6: 59 930 117–59 930 174, 58 basesExão 7: 59 931 622–59 931 722, 101 basesExão 8: 59 934 170–59 934 260, 91 basesExão 9: 59 934 434–59 934 524, 91 basesExão 10: 59 935 193–59 935 300, 108 basesExão 11: 59 936 215–59 936 277, 63 basesExão 12: 59 936 464–59 936 541, 78 basesExão 13: 59 940 836–59 940 943, 108 basesExão 14: 59 945 406–59 945 518, 113 basesExão 15: 59 946 551–59 950 574, 4024 bases1510155′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 5,4 kb dos 57,5 kb do gene; 1578 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de RPS6KB1

72Difícil

Grau de dificuldade de sequenciar RPS6KB1 com leituras curtas, numa escala de 0 a 100

Grande parte de RPS6KB1 se situa em zonas onde as leituras curtas podem falhar ou posicionar mal uma alteração.

O que acresce: a proporção dos exões de RPS6KB1 em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade35%
  • Homologia92%
  • Partilhado com o chrY0%
  • Cobertura da referência0%
  • Repetições5,2%
  • Conteúdo em GC6,4%

Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene RPS6KB1: ribosomal protein S6 kinase B1. Consultado em 20 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/rps6kb1

Vancouver

Dante Labs. Gene RPS6KB1: ribosomal protein S6 kinase B1 [Internet]. [consultado em 20 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/rps6kb1

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