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Gene

PCYOX1

prenylcysteine oxidase 1

Resumo

Localização citogenética
2p13.3
Coordenadas
Cromossoma 2: 70 258 137–70 281 185 (GRCh38)
Exões
6 exões ao longo de 23 kb
Proteína
505 aminoácidos
Também conhecido como
KIAA0908, PCL1
Transcrito MANE Select
ENST00000433351.7NM_016297.4
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa PCYOX1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como PCYOX1 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 2, com um parêntese onde se situa PCYOX1. PCYOX1 e 14 genes próximos no cromossoma 2, de 69 769 661 a 70 769 660.Cromossoma 22p13.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.369,8 Mb70 Mb70,2 Mb70,4 Mb70,6 MbANXA4: 69 643 109–69 827 121, fita diretaANXA4GMCL1: 69 829 612–69 881 393, fita diretaGMCL1: 69 829 739–69 829 798, fita diretaSNRNP27: 69 893 944–69 907 658, fita diretaSNRNP27MXD1: 69 897 688–69 942 945, fita diretaMXD1ASPRV1: 69 960 089–69 961 631, fita inversaASPRV1: 69 960 104–70 087 320, fita inversaPCBP1: 70 087 477–70 089 203, fita diretaPCBP1C2orf42: 70 149 882–70 248 615, fita inversaC2orf42TIA1: 70 209 444–70 248 761, fita inversaTIA1PCYOX1: 70 258 137–70 281 185, fita diretaPCYOX1SNRPG: 70 281 204–70 293 766, fita inversaSNRPGTIMCC: 70 295 975–70 302 086, fita inversaTIMCCTGFA: 70 447 284–70 554 193, fita inversaTGFAADD2: 70 607 618–70 768 499, fita inversaADD2Diagrama de PCYOX1: 6 exões na cadeia direta do cromossoma 2Exão 1: 70 258 137–70 258 276, 140 basesExão 2: 70 259 360–70 259 566, 207 basesExão 3: 70 261 212–70 261 386, 175 basesExão 4: 70 274 959–70 275 170, 212 basesExão 5: 70 275 514–70 275 666, 153 basesExão 6: 70 276 734–70 281 185, 4452 bases1234565′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 5,3 kb dos 23 kb do gene; 1518 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de PCYOX1

2Fácil

Dificuldade de sequenciação de PCYOX1 com leituras curtas, em 100

Quase todos os exões de PCYOX1 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.

O que acresce: a proporção dos exões de PCYOX1 em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Shared with chrY0%
  • Cobertura da referência0%
  • Repetições3,4%
  • Conteúdo GC2,6%

Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene PCYOX1: prenylcysteine oxidase 1. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/pcyox1

Vancouver

Dante Labs. Gene PCYOX1: prenylcysteine oxidase 1 [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/pcyox1

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