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Gene

LRRC4C

leucine rich repeat containing 4C

Resumo

Localização citogenética
11p12
Coordenadas
Cromossoma 11: 40 114 209–41 459 652 (GRCh38)
Exões
7 exões ao longo de 1345,4 kb
Proteína
640 aminoácidos
Também conhecido como
KIAA1580, NGL-1
Transcrito MANE Select
ENST00000528697.6NM_001258419.2
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa LRRC4C ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como LRRC4C está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 11, com um parêntese onde se situa LRRC4C. LRRC4C e 0 genes próximos no cromossoma 11, de 38 768 765 a 42 805 096.Cromossoma 1111p12p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2539 Mb39,5 Mb40 Mb40,5 Mb41 Mb41,5 Mb42 Mb42,5 MbLRRC4C: 40 114 209–41 459 652, fita inversaLRRC4CDiagrama de LRRC4C: 7 exões na cadeia inversa do cromossoma 11Exão 7: 40 114 209–40 116 334, 2126 basesExão 6: 40 140 801–40 140 853, 53 basesExão 5: 40 241 519–40 241 598, 80 basesExão 4: 40 319 628–40 319 721, 94 basesExão 3: 40 648 142–40 648 278, 137 basesExão 2: 40 933 635–40 933 723, 89 basesExão 1: 41 459 431–41 459 652, 222 bases76543215′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 2,8 kb dos 1345,4 kb do gene; 1923 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de LRRC4C

1Fácil

Grau de dificuldade de sequenciar LRRC4C com leituras curtas, numa escala de 0 a 100

Quase todos os exões de LRRC4C se encontram em zonas onde as leituras curtas se alinham de forma limpa.

Fatores que contribuem: a proporção dos exões de LRRC4C em cada tipo de região difícil

  • Mappability0%
  • Homologia0%
  • Repetições7,1%
  • Conteúdo GC0%
  • Cobertura da referência0%

Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e nos mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene LRRC4C: leucine rich repeat containing 4C. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/lrrc4c

Vancouver

Dante Labs. Gene LRRC4C: leucine rich repeat containing 4C [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/lrrc4c

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