Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

LRRC4C

leucine rich repeat containing 4C

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
11p12
Koordináták
11. kromoszóma: 40 114 209–41 459 652 (GRCh38)
Exonok
7 exon, összesen 1345,4 kb
Fehérje
640 aminosav
Más néven ismert
KIAA1580, NGL-1
MANE Select transzkriptum
ENST00000528697.6NM_001258419.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) LRRC4C gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A LRRC4C felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
11. kromoszóma, a LRRC4C helyét zárójel jelöli. A LRRC4C és környékén 0 gén a 11. kromoszómán, 38 768 765–42 805 096 között.11. kromoszóma11p12p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2539 Mb39,5 Mb40 Mb40,5 Mb41 Mb41,5 Mb42 Mb42,5 MbLRRC4C: 40 114 209–41 459 652, fordított szálLRRC4CA LRRC4C ábrája: 7 exon a(z) 11. kromoszóma fordított szálán7. exon: 40 114 209–40 116 334, 2126 bázis6. exon: 40 140 801–40 140 853, 53 bázis5. exon: 40 241 519–40 241 598, 80 bázis4. exon: 40 319 628–40 319 721, 94 bázis3. exon: 40 648 142–40 648 278, 137 bázis2. exon: 40 933 635–40 933 723, 89 bázis1. exon: 41 459 431–41 459 652, 222 bázis76543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 1345,4 kb-jából 2,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1923 bázis kódolja a fehérjét.

LRRC4C szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a LRRC4C szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A LRRC4C exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a LRRC4C exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések7,1%
  • GC-tartalom0%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). LRRC4C gén: leucine rich repeat containing 4C. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/lrrc4c

Vancouver

Dante Labs. LRRC4C gén: leucine rich repeat containing 4C [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/lrrc4c

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet