Gene
LINC02747
long independently transcribed non-coding RNA 2747
- HGNC 54266↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000255774↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 105379407↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 11q13.3
- Coordenadas
- Cromossoma 11: 69 475 604–69 479 957 (GRCh38)
- Exões
- 2 exões ao longo de 4,4 kb
- Também conhecido como
- AP000439.3, CUPID2, AP000439.2
- Transcrito MANE Select
- ENST00000542064.4NR_184307.2
- Tipo de locus
- RNA longo não codificante (lncRNA)
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page$gene$nameAnalise LINC02747, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Como LINC02747 está organizado
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 2,3 kb dos 4,4 kb do gene.
Sequenciação de LINC02747
3Baixo
Grau de dificuldade de sequenciar LINC02747 com leituras curtas, em 100Cada barra é a proporção das bases de exões de LINC02747 que estão nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem para uma chamada de leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não abranger. Peso 15%.0%
- Teor de GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre mal. Peso 10%.33%
- Cobertura de referênciaLacunas na montagem de referência próxima, onde não há sequência à qual as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene LINC02747: long independently transcribed non-coding RNA 2747. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/linc02747
Dante Labs. Gene LINC02747: long independently transcribed non-coding RNA 2747 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/linc02747
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