Gene
H3C15
H3 clustered histone 15
- HGNC 20505↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000203852↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 333932↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 1q21.2
- Coordenadas
- Cromossoma 1: 149 852 608–149 853 125 (GRCh38)
- Exões
- 1 exão ao longo de 0,5 kb
- Proteína
- 136 aminoácidos
- Também conhecido como
- H3/n, H3/o
- Símbolos anteriores
- HIST2H3A
- Transcrito MANE Select
- ENST00000403683.2NM_001005464.3
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
Esta página como dados
Acrescente .json ao endereço da página, ou peça application/json, para a ler como JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/h3c15.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameAnalise H3C15, e o resto do seu genoma, com um único teste.
A partir de 449 $Envio gratuito · Resultados em 6–8 semanas
Obter o meu Genome TestRelatórios com curadoria relevantes para este gene
Nenhum relatório do Genome Test analisa H3C15 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.
Como H3C15 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 0,5 kb dos 0,5 kb do gene; 411 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de H3C15
72Difícil
Grau de dificuldade de sequenciar H3C15 com leituras curtas, numa escala de 0 a 100
0 · Fácil100 · Difícil
Grande parte de H3C15 encontra-se em zonas onde as leituras curtas podem não detetar ou posicionar mal uma alteração.
Fatores que contribuem: a proporção dos exões de H3C15 em cada tipo de região difícil
- MappabilityTrechos em que leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.100%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.100%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, onde as leituras podem deslizar e podem não as abranger. Peso 15%.0%
- Conteúdo GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma insuficiente. Peso 10%.73%
- Cobertura da referênciaLacunas na montagem de referência nas proximidades, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Peso 10%.0%
Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e nos mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de H3C15 nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo de cada uma numa chamada com leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em qualquer região, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene H3C15: H3 clustered histone 15. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/h3c15
Dante Labs. Gene H3C15: H3 clustered histone 15 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/h3c15
Um teste. Respostas para toda a vida.
A partir de 449 $Envio gratuito · Resultados em 6–8 semanas