Gen
LINC01488
long independently transcribed non-coding RNA 1488
- HGNC 51144↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000285094↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 101928292↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 11q13.3
- Współrzędne
- Chromosom 11: 69 481 663–69 493 210 (GRCh38)
- Eksony
- 4 eksonów na odcinku 11,5 kb
- Znany również jako
- CUPID1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000717996.1NR_185875.1
- Typ locus
- Długie niekodujące RNA (lncRNA)
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/linc01488.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj LINC01488 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu LINC01488. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.
Budowa genu LINC01488
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 2,3 kb z 11,5 kb genu.
Sekwencjonowanie LINC01488
0Niski
Jak trudno sekwencjonować LINC01488 krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych LINC01488 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.2,8%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.0%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen LINC01488: long independently transcribed non-coding RNA 1488. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/linc01488
Dante Labs. Gen LINC01488: long independently transcribed non-coding RNA 1488 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/linc01488
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni