Gen
LINC01488
long independently transcribed non-coding RNA 1488
- HGNC 51144↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000285094↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 101928292↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 11q13.3
- Koordinatlar
- Kromozom 11: 69.481.663–69.493.210 (GRCh38)
- Eksonlar
- 11,5 kb boyunca 4 ekson
- Diğer adları
- CUPID1
- MANE Select transkripti
- ENST00000717996.1NR_185875.1
- Lokus türü
- Uzun kodlamayan RNA (lncRNA)
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/linc01488.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLINC01488 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Hiçbir Genome Test raporu LINC01488 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.
LINC01488 geninin yapısı
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 11,5 kb uzunluğunun 2,3 kb'sini oluşturur.
LINC01488 dizilemesi
0Düşük
100 üzerinden, LINC01488 genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, LINC01488 geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%2,8
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%0
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). LINC01488 geni: long independently transcribed non-coding RNA 1488. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/linc01488
Dante Labs. LINC01488 geni: long independently transcribed non-coding RNA 1488 [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/linc01488
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde