Gen
LINC01488
long independently transcribed non-coding RNA 1488
- HGNC 51144↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000285094↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 101928292↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 11q13.3
- Koordinater
- Kromosom 11: 69 481 663–69 493 210 (GRCh38)
- Exoner
- 4 exoner på 11,5 kb
- Även känd som
- CUPID1
- MANE Select-transkript
- ENST00000717996.1NR_185875.1
- Lokustyp
- Långt icke-kodande RNA (lncRNA)
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/linc01488.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs LINC01488, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser LINC01488 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är LINC01488 uppbyggd
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,3 kb av genens 11,5 kb.
Sekvensering av LINC01488
0Låg
Hur svår LINC01488 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av LINC01488s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.2,8 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Externa länkar
Genposter
Transkript
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). LINC01488-genen: long independently transcribed non-coding RNA 1488. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/linc01488
Dante Labs. LINC01488-genen: long independently transcribed non-coding RNA 1488 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/linc01488
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor