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Gene

LINC01488

long independently transcribed non-coding RNA 1488

Sintesi

Localizzazione citogenetica
11q13.3
Coordinate
Cromosoma 11: 69.481.663–69.493.210 (GRCh38)
Esoni
4 esoni su 11,5 kb
Noto anche come
CUPID1
Trascritto MANE Select
ENST00000717996.1NR_185875.1
Tipo di locus
RNA lungo non codificante (lncRNA)

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora LINC01488. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di LINC01488

  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 11, con una parentesi dove si trova LINC01488. LINC01488 e 11 geni nelle vicinanze sul cromosoma 11, da 68.987.437 a 69.987.436.Cromosoma 1111q13.3p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2569 Mb69,2 Mb69,4 Mb69,6 Mb69,8 MbMRGPRF: 69.004.376–69.014.407, filamento inversoMRGPRFTPCN2: 69.048.844–69.136.317, filamento direttoTPCN2: 69.072.915–69.162.440, filamento direttoSMIM38: 69.155.478–69.162.440, filamento direttoSMIM38MYEOV: 69.294.114–69.341.682, filamento direttoMYEOVLINC01488: 69.481.663–69.493.210, filamento direttoLINC01488CCND1: 69.641.070–69.654.474, filamento direttoCCND1LTO1: 69.653.072–69.675.416, filamento inversoLTO1FGF19: 69.698.232–69.704.660, filamento inversoFGF19FGF4: 69.771.022–69.775.344, filamento inversoFGF4FGF3: 69.809.968–69.819.416, filamento inversoFGF3ANO1: 69.985.907–70.189.543, filamento direttoANO1Diagramma di LINC01488: 4 esoni sul filamento diretto del cromosoma 11Esone 1: 69.481.663–69.481.783, 121 basiEsone 2: 69.486.040–69.486.143, 104 basiEsone 3: 69.490.495–69.491.441, 947 basiEsone 4: 69.492.101–69.493.210, 1110 basi12345′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,3 kb dei 11,5 kb del gene.

Sequenziamento di LINC01488

0Facile

Quanto è difficile sequenziare LINC01488 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di LINC01488 si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di LINC01488 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni2,8%
  • Contenuto GC0%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

Cita questa pagina

APA

Dante Labs. (s.d.). Gene LINC01488: long independently transcribed non-coding RNA 1488. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/linc01488

Vancouver

Dante Labs. Gene LINC01488: long independently transcribed non-coding RNA 1488 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/linc01488

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