Gen
H1-8
H1.8 linker histone
- HGNC 18463↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000178804↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 132243↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 3q22.1
- Współrzędne
- Chromosom 3: 129 543 175–129 551 467 (GRCh38)
- Eksony
- 5 eksonów na odcinku 8,3 kb
- Białko
- 346 aminokwasów
- Poprzednie symbole
- H1FOO
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000324382.7NM_153833.3
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/h1-8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj H1-8 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu H1-8. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.
Budowa genu H1-8
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,2 kb z 8,3 kb genu; 1041 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie H1-8
3Łatwo
Jak trudno sekwencjonować H1-8 krótkimi odczytami, w skali 0–100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of H1-8's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of H1-8's exons in each kind of hard region
- MapowalnośćOdcinki, na których odczyty 100 lub 250 bp nie mogą być jednoznacznie umieszczone, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, na przykład paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i mogą ich nie obejmować. Waga 15%.0%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 10%.34%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim zestawie referencyjnym, gdzie brak sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredKażdy słupek to udział zasad eksonów H1-8 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je według tego, jak bardzo każda zasada utrudnia wywołanie krótkim odczytem: 0, gdy żadna zasada nie leży w żadnym regionie, 100, gdy każda zasada leży we wszystkich.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Kliniczne
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen H1-8: H1.8 linker histone. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/h1-8
Dante Labs. Gen H1-8: H1.8 linker histone [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/h1-8
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni