Gen
SUPT5H
SPT5 homolog, DSIF elongation factor subunit
- HGNC 11469↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000196235↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 6829↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 19q13.2
- Koordinater
- Kromosom 19: 39 445 582–39 476 670 (GRCh38)
- Eksoner
- 30 eksoner over 31,1 kb
- Protein
- 1 087 aminosyrer
- Også kjent som
- SPT5H, SPT5, FLJ34157
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000432763.7NM_001111020.3
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/supt5h.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes SUPT5H og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser SUPT5H ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er SUPT5H bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 3,7 kb av genets 31,1 kb, og 3 264 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av SUPT5H
2Lav
Hvor vanskelig SUPT5H er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av SUPT5Hs eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.6,1 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.15 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). SUPT5H-genet: SPT5 homolog, DSIF elongation factor subunit. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/supt5h
Dante Labs. SUPT5H-genet: SPT5 homolog, DSIF elongation factor subunit [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/supt5h
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker