Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

SHKBP1

SH3KBP1 binding protein 1

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
19q13.2
Koordinater
Kromosom 19: 40 576 873–40 591 397 (GRCh38)
Eksoner
18 eksoner over 14,5 kb
Protein
707 aminosyrer
Også kjent som
PP203, Sb1
MANE Select-transkripsjon
ENST00000291842.10NM_138392.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser SHKBP1 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er SHKBP1 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 19, med en parentes der SHKBP1 står. SHKBP1 og 28 gener i nærheten på kromosom 19, fra 40 084 135 til 41 084 134.Kromosom 1919q13.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4340,2 Mb40,4 Mb40,6 Mb40,8 Mb41 MbZNF780A: 40 069 152–40 091 140, bakover-strengZNF780AMAP3K10: 40 191 412–40 215 579, fremover-strengMAP3K10TTC9B: 40 216 058–40 218 521, bakover-strengTTC9BCCNP: 40 222 208–40 226 697, bakover-strengCCNPAKT2: 40 230 317–40 285 536, bakover-strengAKT2C19orf47: 40 294 427–40 348 547, bakover-strengC19orf47PLD3: 40 348 453–40 389 472, fremover-strengPLD3HIPK4: 40 379 271–40 390 181, bakover-strengHIPK4PRX: 40 393 764–40 415 070, bakover-strengPRXSERTAD1: 40 421 589–40 426 001, bakover-strengSERTAD1SERTAD3: 40 440 642–40 445 114, bakover-strengSERTAD3BLVRB: 40 446 758–40 465 826, bakover-strengBLVRBSPTBN4: 40 466 241–40 576 464, fremover-strengSPTBN4SHKBP1: 40 576 873–40 591 397, fremover-strengSHKBP1LTBP4: 40 592 883–40 629 821, fremover-strengLTBP4NUMBL: 40 665 905–40 690 972, bakover-strengNUMBLCOQ8B: 40 691 514–40 725 784, bakover-strengCOQ8BITPKC: 40 716 964–40 740 860, fremover-strengITPKCACTMAP: 40 740 856–40 751 813, bakover-strengACTMAPSNRPA: 40 750 585–40 765 393, fremover-strengSNRPAMIA: 40 768 997–40 777 490, fremover-strengMIAMIA-RAB4B: 40 771 648–40 796 943, fremover-strengRAB4B: 40 778 191–40 798 690, fremover-strengRAB4BRAB4B-EGLN2: 40 778 242–40 808 418, fremover-strengEGLN2: 40 798 996–40 857 708, fremover-strengEGLN2: 40 801 297–40 898 282, fremover-strengCYP2A6: 40 841 915–40 850 493, bakover-strengCYP2A6CYP2A7: 40 873 525–40 882 752, bakover-strengCYP2A7CYP2B6: 40 991 131–41 018 413, fremover-strengCYP2B6Diagram av SHKBP1: 18 eksoner på fremover-strengen til kromosom 19Ekson 1: 40 576 873–40 576 985, 113 baserEkson 2: 40 577 231–40 577 284, 54 baserEkson 3: 40 577 396–40 577 441, 46 baserEkson 4: 40 577 557–40 577 630, 74 baserEkson 5: 40 578 154–40 578 212, 59 baserEkson 6: 40 578 462–40 578 542, 81 baserEkson 7: 40 580 324–40 580 485, 162 baserEkson 8: 40 580 566–40 580 656, 91 baserEkson 9: 40 580 746–40 580 936, 191 baserEkson 10: 40 582 351–40 582 466, 116 baserEkson 11: 40 583 398–40 583 485, 88 baserEkson 12: 40 583 601–40 583 717, 117 baserEkson 13: 40 586 774–40 586 944, 171 baserEkson 14: 40 588 624–40 588 779, 156 baserEkson 15: 40 589 082–40 589 178, 97 baserEkson 16: 40 590 244–40 590 422, 179 baserEkson 17: 40 590 730–40 590 853, 124 baserEkson 18: 40 590 976–40 591 397, 422 baser1246810121416185′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 2,3 kb av genets 14,5 kb, og 2 124 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av SHKBP1

4Lav

Hvor vanskelig SHKBP1 er å sekvensere med korte leser, av 100

  • Kartleggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Repetisjoner0,5 %
  • GC-innhold36 %
  • Referansedekning0 %

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). SHKBP1-genet: SH3KBP1 binding protein 1. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/shkbp1

Vancouver

Dante Labs. SHKBP1-genet: SH3KBP1 binding protein 1 [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/shkbp1

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test